全ゲノムシークエンシングにより同定された家族性肥大型心筋症の遺伝性の可能性

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Mol Genet Genomic Med.2020 Mar;8(3):e1150. doi: 10.1002/mgg3.1150.Epub 2020-01-20.

全ゲノムシークエンシングにより同定された家族性肥大型心筋症の遺伝性の可能性

Potential digenic inheritance of familial hypertrophic cardiomyopathy identified by whole-exome sequencing.

Ming-Bao Ren
Xiao-Rui Chai
Lin Li
Xin Wang
Chenghong Yin

PMID: 31960626 PMCID: PMC7057083. DOI: 10.1002/mgg3.1150.

抄録

背景:

本研究の目的は、肥大型心筋症（HCM）患者の家族内の遺伝的原因を明らかにすることであった。これまでの研究の多くは点突然変異がHCMの遺伝的原因とされていたが、全遺伝子欠失はほとんど報告されていなかった。

BACKGROUND: The aim of this study was to identify the genetic causes of patients with hypertrophic cardiomyopathy (HCM) within a family. Most of the previous studies found point mutations as the genetic causes for HCM, whole-gene deletion was rarely reported.

方法:

臨床遺伝学的検査はHCM患者の変異体を同定するために広く用いられてきたが、利用可能な方法論が不十分であることもあり、構造的変異は十分に研究されていなかった。本研究では、家族性HCM患者の遺伝的原因を特定するために、全ゲノムシークエンシング（WES）とサンガーシークエンシングの検証を行った。

METHODS: Although, clinical genetic testing has been widely used for identifying variants in HCM patients, structural variations are understudied, partly owing to the inadequacy of the available methodology. In the present study, whole-exome sequencing (WES) and Sanger sequencing validation was used to identify the genetic causes in patients with familial HCM.

結果:

トロポニンI3遺伝子全体を含む19番染色体のゲノム欠失（TNI3）とミオシン重鎖7遺伝子（MYH7）のp.Ile736Thr変異がWESにより2人の家族性HCM患者で同定された。このp.Ile736Thr変異は、Sanger塩基配列決定によりさらに検証され、in silico解析により病原性変異として予測された。

RESULTS: A genomic deletion in Chromosome 19 containing the whole of troponin I3 gene (TNNI3), and the p.Ile736Thr variant in the myosin heavy chain 7 gene (MYH7) were identified in two patients with familial HCM by WES. The p.Ile736Thr variant is further validated by Sanger sequencing and is predicted as a pathogenic variant by in silico analysis.

結論:

また、MYH7のp.Ile736Thr変異だけでなく、TNNI3欠失もHCMの発症に関与している可能性があると考えられた。また、WESはHCMの原因となる遺伝子変異を同定するための強力なツールであることが示唆された。

CONCLUSION: We added the notion that not only p.Ile736Thr variant of MYH7, but also TNNI3 deletion might potentially contribute to HCM pathogenesis. Our study also suggested WES was a powerful tool to identify the genetic variants causing HCM.