スフィンゴ脂質代謝経路における遺伝子ペア相関係数の乳がん予後バイオマーカーとしての可能性

Gene Pair Correlation Coefficients in Sphingolipid Metabolic Pathway as a Potential Prognostic Biomarker for Breast Cancer.

• Meena Kishore Sakharkar
• Sarinder Kaur Dhillon
• Saravana Babu Chidambaram
• Musthafa Mohamed Essa
• Jian Yang

抄録

癌のような複雑な疾患は、通常、複数の遺伝子の動的かつ同時的な変化に支配されています。スフィンゴ脂質は強力な生理活性分子であり、発がんなど多くの重要な病態を制御していることから、我々は乳がん患者と健常者の間で36の遺伝子（スフィンゴ脂質代謝経路に関わる31の遺伝子とスフィンゴシン-1-リン酸受容体をコードする5つの遺伝子）の遺伝子ペア相関を調べた。その結果、健常対照者では広く強く相関していたが、乳がん患者では一般的に遺伝子発現が失われていたことが明らかになった。本研究は、遺伝子ペア相関係数が乳がんの診断・予後診断に系統的かつ新規な手法として応用できることを示唆している。

Complex diseases such as cancer are usually governed by dynamic and simultaneous modifications of multiple genes. Since sphingolipids are potent bioactive molecules and regulate many important pathophysiological processes such as carcinogenesis, we studied the gene pair correlations of 36 genes (31 genes in the sphingolipid metabolic pathway and 5 genes encoding the sphingosine-1-phosphate receptors) between breast cancer patients and healthy controls. It is remarkable to observe that the gene expressions were widely and strongly correlated in healthy controls but in general lost in breast cancer patients. This study suggests that gene pair correlation coefficients could be applied as a systematic and novel method for the diagnosis and prognosis of breast cancer.