ロシア・シベリアのIxodes persulcatus/Ixodes trianguliceps同属地域における小型哺乳類およびマダニに循環するAnaplasmataceaeの遺伝的変動

Genetic variability of Anaplasmataceae circulating in small mammals and ticks in an Ixodes persulcatus/Ixodes trianguliceps sympatric area in Russian Siberia.

• Vera Rar
• Valeriy Yakimenko
• Artem Tikunov
• Marat Makenov
• Tamara Epikhina
• Aleksey Tancev
• Nina Tikunova

抄録

2013年から2018年にかけて、ロシア・シベリアのオムスク県で、Myodes属、Microtus属、Apodemus属の合計705匹のげっ歯類、396匹の採集中のIxodes persulcatus成虫、およびげっ歯類から採取した115匹のIxodes幼虫とニンフ（その後、実験室条件下で脱皮してニンフと成虫になったもの）を採取し、Anaplasmataceaeの存在を調べた。29.5%の齧歯類、3.8%の探翅I. persulcatus、2回の脱皮した成虫I. persulcatus、1回の脱皮した成虫Ixodes triangulicepsからAnaplasma phagocytophilumのDNAが検出された。Ehrlichia murisのDNAは、げっ歯類12.1％、採集中のI. persulcatus 3.0％、脱皮した成虫I. persulcatus 14％、脱皮した成虫I. trianguliceps 1名の検体から検出された。血液検体の0.6％にNeoehrlichia mikurensisのDNAが検出された。調査地域では主にA. phagocytophilumとE. murisがそれぞれI. triangulicepsとI. persulcatusによって小げっ歯類に感染していることが示唆された。groEL遺伝子配列解析に基づき、A. phagocytophilumの3つの系統クラスター（クラスター4、5、6、Jaarsmaら、2019によると）を同定した。齧歯類から得られたA. phagocytophilumの遺伝子型分離株の大部分（87.6％）と脱皮した成体I. triangulicepsから検出された単一の分離株がクラスター5に属していた。クラスター6にはげっ歯類から11.8％の遺伝子型を持つ検体が含まれていたが，クラスター4には93％の遺伝子型を持つ検体が含まれていたが，脱皮した成虫I. persulcatusが1匹，脱皮した成虫I. persulcatusが1匹であった．クラスター5および6からのA. phagocytophilumの検出は、クラスター5および6がダニの媒介者によって分離していることを示しているが、地域によっては分離していないことを示している。E. murisとN. mikurensisの遺伝子型の多くは，以前にアジアロシアで検出された典型的な遺伝子型に対応していた．また，E. murisとN. mikurensisの遺伝子型は，他の既知の分離株とは大きく異なり，系統樹上で別の枝を形成していることが数頭のハチで確認された。

A total of 705 rodents from Myodes, Microtus, and Apodemus genera, 396 adult questing Ixodes persulcatus, and 115 Ixodes larvae and nymphs taken from rodents (and then molted under laboratory conditions to nymphs and adults) were collected in 2013-2018 in Omsk province, Russian Siberia, and examined for the presence of Anaplasmataceae. DNA of Anaplasma phagocytophilum was detected in 29.5 % rodents, 3.8 % questing I. persulcatus, two molted adult I. persulcatus, and one molted adult Ixodes trianguliceps. Ehrlichia muris DNA was found in specimens from 12.1 % rodents, 3.0 % questing I. persulcatus, 14 % molted adult I. persulcatus, and one molted adult I. trianguliceps. Neoehrlichia mikurensis DNA was found in 0.6 % blood samples. It was suggested that in the studied area A. phagocytophilum and E. muris are mainly transmitted to small rodents by I. trianguliceps and I. persulcatus, respectively. Based on groEL gene sequence analysis, three phylogenetic clusters of A. phagocytophilum (clusters 4, 5, 6, according to Jaarsma et al., 2019) were identified. Most of genotyped A. phagocytophilum isolates obtained from rodents (87.6 %) and a single isolate found in a molted adult I. trianguliceps belonged to cluster 5. Cluster 6 contained 11.8 % genotyped specimens from rodents, and one questing and two molted adult I. persulcatus, while cluster 4 included specimens from 93 % genotyped questing I. persulcatus and one vole. The finding of A. phagocytophilum from clusters 5 and 6 in voles from the same sampling area indicated that clusters 5 and 6 segregate according to the tick-carriers, but not the geography. Most of the genotyped specimens of E. muris and N. mikurensis corresponded to typical genotypes detected in Asian Russia previously. In addition, new genetic variants of E. muris and N. mikurensis, which significantly differed from other known isolates and formed separate branches on phylogenetic trees, were identified in several voles.

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