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宿主由来のバイオマーカーと患者特性を組み合わせることで、結核治療成績の予測におけるシグネチャの性能が向上する
Combining host-derived biomarkers with patient characteristics improves signature performance in predicting tuberculosis treatment outcomes.
PMID: 32647325 PMCID: PMC7347567. DOI: 10.1038/s42003-020-1087-x.
抄録
結核(TB)は世界的な健康問題である。結核治療は長期化しており、抗結核治療を受けている患者は様々な理由で治療に失敗することが多く、治療の失敗を早期に発見し、治療の切り替えを開始することが急務となっています。我々は、標準的なATT治療を受けたインドの成人肺結核患者を対象に、遺伝子バイオマーカーや基本的な患者特性を用いて、治療成績の特徴を明らかにする方法を検討した。ベースライン時の血液サンプルを用いて、性別、結核既往症、重度の薄毛、喫煙、飲酒量などの情報を組み合わせた12の遺伝子シグネチャーが、6ヵ月後の治療失敗を高確率で予測した。同様に、同じ患者の特徴を持つ4タンパク質のバイオマーカーを組み合わせた場合も、ほぼ同じくらい高い治療失敗予測率を示した。バイオマーカーと患者の基本的な特徴を組み合わせることは、結核治療の初期段階での治療失敗の予測、ひいては治療失敗の特定に有用であると考えられる。
Tuberculosis (TB) is a global health concern. Treatment is prolonged, and patients on anti-TB therapy (ATT) often experience treatment failure for various reasons. There is an urgent need to identify signatures for early detection of failure and initiation of a treatment switch.We investigated how gene biomarkers and/or basic patient characteristics could be used to define signatures for treatment outcomes in Indian adult pulmonary-TB patients treated with standard ATT. Using blood samples at baseline, a 12-gene signature combined with information on gender, previously-diagnosed TB, severe thinness, smoking and alcohol consumption was highly predictive of treatment failure at 6 months. Likewise a 4-protein biomarker signature combined with the same patient characteristics was almost as highly predictive of treatment failure. Combining biomarkers and basic patient characteristics may be useful for predicting and hence identification of treatment failure at an early stage of TB therapy.