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教師なしモデル化とゲノムワイドな関連性により、アレルギー性マーチの軌跡の新規特徴が明らかになった
Unsupervised Modeling and Genome-Wide Association Identify Novel Features of Allergic March Trajectories.
PMID: 32650023 DOI: 10.1016/j.jaci.2020.06.026.
抄録
背景:
アレルギーマーチとは、乳児期や小児期のアレルギー疾患の自然史を指す。しかし、集団レベルの疾患発生パターンは、必ずしも個人のアレルギー疾患の発症を反映しているとは限らない。異なるアレルギー性疾患の発症経路を引き起こす要因をよりよく理解することが必要である。
BACKGROUND: The allergic march refers to the natural history of allergic conditions during infancy and childhood. However, population-level disease incidence patterns do not necessarily reflect the development of allergic disease in individuals. A better understanding of the factors that predispose to different allergic trajectories is needed.
目的:
主要なアレルギー性マーチの軌跡と関連する人口統計学的および遺伝的特徴を決定する。
OBJECTIVE: Determine the demographic and genetic features that associate with the major allergic march trajectories.
方法:
158,510人の小児プライマリケア出生コホートにおいて、一般的なアレルギー疾患（アトピー性皮膚炎、AD、IgE介在性食物アレルギー、IgE-FA、喘息、およびアレルギー性鼻炎、AR）の有無を確認した。人口統計学的特徴とアレルギーの転帰との関連付けには、階層的クラスタリングおよび決定木モデリングが用いられた。ゲノムワイド関連研究（GWAS）では、特定のアレルギーの軌跡に関連するリスク遺伝子座を調べた。
METHODS: Presence or absence of common allergic conditions (atopic dermatitis, AD; IgE-mediated food allergy, IgE-FA; asthma; and allergic rhinitis, AR) was ascertained in a pediatric primary care birth cohort of 158,510 subjects. Hierarchical clustering and decision tree modeling was used to associate demographic features with allergic outcomes. Genome-wide association study (GWAS) tested for risk loci associated with specific allergic trajectories.
結果:
自称「黒人」人種とADから喘息への進行との関連を見いだした。逆に、「アジアまたは太平洋諸島人」の人種はADからIgE-FAへ、「白人」の人種はADからARへと関連していた。軌跡群のGWASは、ADから喘息への進行（rs60242841）、およびADからARへの進行（rs9565267、rs151041509、rs78171803）に関連するリスク遺伝子座を同定した。我々の疫学的な関連性と一致して、rs60242841はヨーロッパ系（EA）よりもアフリカ系（AA）の個人に多く、一方、rs9565267とrs151041509はAAよりもEAの個人に多く見られた。
RESULTS: We found an association between self-identified "Black" race and progression from AD to asthma. Conversely, "Asian or Pacific Islander" race associated with AD to IgE-FA, and "White" race associated with AD to AR. GWAS of trajectory groups identified risk loci associated with progression from AD to Asthma (rs60242841), and AD to AR (rs9565267, rs151041509, rs78171803). Consistent with our epidemiologic associations, rs60242841 is more common in individuals of African ancestry (AA) than European ancestry (EA), while rs9565267 and rs151041509 are more common in EA than AA individuals.
結論:
我々は、人種とアレルギー疾患の進行との間の新たな関連を明らかにした。先祖代々の遺伝的差異がこれらの関連に寄与している可能性がある。これらの結果は、重要な健康格差を明らかにし、アレルギー性行進の概念を洗練させ、これらの疾患に対する個別化された医学的アプローチの開発に向けた一歩を示すものである。
CONCLUSION: We identify novel associations between race and progression along distinct allergic trajectories. Ancestral genetic differences may contribute to these associations. These results uncover important health disparities, refine the concept of the allergic march, and represent a step towards developing individualized medical approaches for these conditions.
Copyright © 2020. Published by Elsevier Inc.