gen.nov. sp.nov.は、地衣類の最初のバクテリオクロロフィルを含有し、精神親和性および酸性親和性のバクテリオビオンである

gen. nov., sp. nov., the first bacteriochlorophyll -containing, psychrophilic and acidophilic bacteriobiont of lichen species.

• Timofey A Pankratov
• Denis S Grouzdev
• Ekaterina O Patutina
• Tatiana V Kolganova
• Julia J Berestovskaya
• Aleksandr A Ashikhmin

抄録

グラム陰性、好気性、化学有機栄養性、バクテリオクロロフィル含有菌株KEBCLARHB70R、KAMCLST3051およびKAMCLST3152を地衣類から分離した。これらの菌株の細胞はコッコ状であり，二分化して繁殖していた。これらの菌株は成長初期に運動性を示し，糖やアルコールを利用していた。全ての菌株は、pH3.5〜7.5（最適はpH5.5）、4〜30℃（最適は10〜15℃）で生育可能であり、好塩性と好酸性を有していた。主要脂肪酸はＣω７、Ｃ；脂質はホスファチジルコリン、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジン酸、ホスファチジルグリセロール、糖脂質、ジホスファチジルグリセロール、構造不明の極性脂質であった。キノンはＱ-１０であった。DNAのG+C含量は67.8"Zs_200A"mol%であった。16S rRNA遺伝子の比較解析から、KEBCLARHB70R株、KAMCLST3051株、KAMCLST3152株は同種であることが明らかになった。KEBCLARHB70R株の全ゲノム解析と平均アミノ酸同一性値の解析から，KEBCLARHB70R株は同属に属することが確認された。KEBCLARHB70R株，KAMCLST3051株，KAMCLST3152株は，表現型，生態学的，ゲノム学的特徴から，同属のすべての菌種と区別された。このことから，これらの新属と新種（gen. nov.KEBCLARHB70R (=KCTC 72321=VKM B-3305)を型株とした。

Gram-negative, aerobic, chemo-organotrophic and bacteriochlorophyll -containing bacterial strains, KEBCLARHB70R, KAMCLST3051 and KAMCLST3152, were isolated from the thalli of and lichens. Cells from the strains were coccoid and reproduced by binary division. They were motile at the early stages of growth and utilized sugars and alcohols. All strains were psychrophilic and acidophilic, capable of growth between pH 3.5 and 7.5 (optimum, pH 5.5), and at 4-30 °C (optimum, 10-15 °C). The major fatty acids were Cω7 and C; the lipids were phosphatidylcholines, phosphatidylethanolamines, phosphatidic acids, phosphatidylglycerol, glycolipids, diphosphatidylglycerol and polar lipids with an unknown structure. The quinone was Q-10. The DNA G+C content was 67.8 mol%. Comparative 16S rRNA gene analysis together with other data, supported that the strains, KEBCLARHB70R, KAMCLST3051 and KAMCLST3152 belonged to the same species. Whole genome analysis of the strain KEBCLARHB70R and average amino acid identity values confirmed its distinctive phylogenetic position within the family . Phenotypic, ecological and genomic characteristics distinguished strains KEBCLARHB70R, KAMCLST3051 and KAMCLST3152 from all genera in the family . Therefore, we propose a novel genus and a novel species, gen. nov., sp. nov., for these novel members. Strain KEBCLARHB70R (=KCTC 72321=VKM B-3305) has been designated as the type strain.