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COVID-19患者のTおよびB細胞受容体レパートリーの次世代シークエンシングにより、疾患の重症度に関連したシグネチャーが示された
Next-Generation Sequencing of T and B Cell Receptor Repertoires from COVID-19 Patients Showed Signatures Associated with Severity of Disease.
PMID: 32668194 DOI: 10.1016/j.immuni.2020.06.024.
抄録
我々は、COVID-19患者の適応免疫をプロファイリングし、これらの患者の血液から現在1,400万以上のBおよびT細胞受容体（BCRおよびTCR）配列のリポジトリを作成しました。B細胞応答は、SARS-CoV-2抗体と密接に関連したIGHV3駆動のBCRクラスターの収束を示した。TCRレパートリーのクローナリティとスキューイングは、インターフェロンI型およびIII型応答、初期のCD4およびCD8 T細胞活性化、および共受容体BTLA、Tim-3、PD-1、TIGIT、およびCD73によるカウンターレギュレーションと関連していた。Tfh、Th17様、および非従来型（ただし古典的な抗ウイルス剤ではない）のTh1細胞分極が誘導された。SARS-CoV-2特異的なT細胞応答は、患者間で共有されたTCRクラスターによって誘導された。我々のデータは、SARS-CoV-2に対する適応免疫についての基本的な知見を提供するものであり、リポジトリは積極的に更新されており、治療コンセプトやワクチン開発のために緊急に必要とされる科学者コミュニティのためのリソースを提供している。
We profiled adaptive immunity in COVID-19 patients with active infection or after recovery and created a repository of currently >14 million B and T cell receptor (BCR and TCR) sequences from the blood of these patients. The B cell response showed converging IGHV3-driven BCR clusters closely associated with SARS-CoV-2 antibodies. Clonality and skewing of TCR repertoires were associated with interferon type I and III responses, early CD4 and CD8 T cell activation, and counterregulation by the co-receptors BTLA, Tim-3, PD-1, TIGIT, and CD73. Tfh, Th17-like, and nonconventional (but not classical antiviral) Th1 cell polarizations were induced. SARS-CoV-2-specific T cell responses were driven by TCR clusters shared between patients with a characteristic trajectory of clonotypes and traceability over the disease course. Our data provide fundamental insight into adaptive immunity to SARS-CoV-2 with the actively updated repository providing a resource for the scientific community urgently needed to inform therapeutic concepts and vaccine development.
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