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アルゼンチンでは、混血個体の詳細なゲノム解析により、これまで認識されていなかった遺伝的先祖の構成要素が明らかになった
Fine-scale genomic analyses of admixed individuals reveal unrecognized genetic ancestry components in Argentina.
PMID: 32673320 DOI: 10.1371/journal.pone.0233808.
抄録
南北アメリカ大陸の他の集団と同様に、アルゼンチンの集団もアフリカ系、ヨーロッパ系、アメリカ先住民の祖先に遺伝的な祖先を遡っており、植民地時代の前後に複数の移民と混血が行われた複雑な人口動態の歴史を反映している。しかし、これら3つの主要な祖先の亜大陸起源については、ほとんど知られていない。我々は、アルゼンチン全土の87人の混血個体について、新しいハイスループットの遺伝子型解析データを発表した。このデータは、過去に発表された同地域の混血個体のデータと組み合わせて、大陸亜大陸レベルでの集団構造解析を行うために特別に構築された異なる参照パネルと比較した。ネイティブアメリカンの祖先に関しては、現代アルゼンチン人の集団の中に4つのネイティブアメリカンの構成要素が存在することが確認された。そのうちの3つは、現代の南米の集団にも見られ、特に、中央アンデス、中央チリ／パタゴニア、亜熱帯／熱帯林の地理的地域に見られる。第四の成分は、アルゼンチンの中央西部地域に特有のものである可能性があり、文献のゲノムデータにはあまり記載されていない。ヨーロッパ系とアフリカ系の祖先については、南ヨーロッパ、西ヨーロッパ、中央西アフリカの祖先についてのこれまでの結果を確認し、北ヨーロッパ系と東アフリカ系の祖先の存在を示す証拠を提供した。
Similarly to other populations across the Americas, Argentinean populations trace back their genetic ancestry into African, European and Native American ancestors, reflecting a complex demographic history with multiple migration and admixture events in pre- and post-colonial times. However, little is known about the sub-continental origins of these three main ancestries. We present new high-throughput genotyping data for 87 admixed individuals across Argentina. This data was combined to previously published data for admixed individuals in the region and then compared to different reference panels specifically built to perform population structure analyses at a sub-continental level. Concerning the Native American ancestry, we could identify four Native American components segregating in modern Argentinean populations. Three of them are also found in modern South American populations and are specifically represented in Central Andes, Central Chile/Patagonia, and Subtropical and Tropical Forests geographic areas. The fourth component might be specific to the Central Western region of Argentina, and it is not well represented in any genomic data from the literature. As for the European and African ancestries, we confirmed previous results about origins from Southern Europe, Western and Central Western Africa, and we provide evidences for the presence of Northern European and Eastern African ancestries.