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パキスタンにおける中等度から重度の散発性難聴における遺伝的変異のスペクトル
Spectrum of genetic variants in moderate to severe sporadic hearing loss in Pakistan.
PMID: 32681043 DOI: 10.1038/s41598-020-68779-5.
抄録
難聴は、環境や遺伝的原因により、世界中で3億8千万人に影響を与えている。家族に難聴の既往歴のない人の難聴の原因を特定することは困難であり、パキスタンでは比較的研究されていない。私たちは、肉親との間に生まれた単身者の難聴者を対象に、難聴の遺伝的変異のスペクトルを調査した。中等度から重度の難聴を持つ21名を募集した。その結果、10の既知の難聴遺伝子と1つの新規候補遺伝子に17の変異が同定された。確認された変異体は、2つの変異体を除いてすべてホモ接合性であった。そのうち11の変異体は新規変異であり、その中にはOTOAにおける1つのマルチエクソニックホモ接合性欠失が含まれていた。ESRRBのミスセンス変異は、劣性遺伝する中等度から重度の難聴に関与していた。2人はそれぞれMYO7AとCHD7の変異体のヘテロ接合体であり、de novo変異体または不完全な貫通性を持つ優性遺伝が難聴の原因であると考えられた。我々の結果は、家族性難聴と同様に、多数の遺伝子の変異が、血縁関係にある夫婦から生まれた散発的な個人の中等度から重度の難聴の原因となっていることを示している。
Hearing loss affects 380 million people worldwide due to environmental or genetic causes. Determining the cause of deafness in individuals without previous family history of hearing loss is challenging and has been relatively unexplored in Pakistan. We investigated the spectrum of genetic variants in hearing loss in a cohort of singleton affected individuals born to consanguineous parents. Twenty-one individuals with moderate to severe hearing loss were recruited. We performed whole-exome sequencing on DNA samples from the participants, which identified seventeen variants in ten known deafness genes and one novel candidate gene. All identified variants were homozygous except for two. Eleven of the variants were novel, including one multi-exonic homozygous deletion in OTOA. A missense variant in ESRRB was implicated for recessively inherited moderate to severe hearing loss. Two individuals were heterozygous for variants in MYO7A and CHD7, respectively, consistent with de novo variants or dominant inheritance with incomplete penetrance as the reason for their hearing loss. Our results indicate that similar to familial cases of deafness, variants in a large number of genes are responsible for moderate to severe hearing loss in sporadic individuals born to consanguineous couples.