バングラデシュのエビ（Penaeus monodon）養殖における白点病（WSD）流行に関する白点病症候群ウイルス（WSSV）の分子的同定と関連リスク要因の解明

Molecular identification of white spot syndrome virus (WSSV) and associated risk factors for white spot disease (WSD) prevalence in shrimp (Penaeus monodon) aquaculture in Bangladesh.

抄録

白点病は過去20年にわたりバングラデシュのエビ養殖業に多大な経済的損失を与えてきた。原因ウイルスであるWSSVは、養殖場の管理状況や環境・季節の変化により、重大な死亡率を伴う深刻な疾病を示すことがある。2018年にバングラデシュの南西地域から養殖場管理と環境パラメータに関するデータを収集し、従来のPCR、リアルタイムPCR、シークエンシングを用いて種特異的遺伝子VP28によりWSSV感染を確認した。二変量解析により、WSDの有意なリスク要因として、農場年齢、育苗池の存在、PLのリザーバー、農場エリアの雑草、雑草の制御、飼養密度、飼養回数、アンモニア、酸素濃度の9つが特定されました。本研究では，従来のPCR法では46のWSSV感染養殖場が検出されたが，リアルタイムPCR法では49養殖場中47のWSSV陽性養殖場が検出された．WSSVの流行はKhulna地域で最も高く，すべての季節で100％陽性であった．WSSVの負荷量は5.62×10〜2.01×10 copies/g（エビ組織）であった．VP28遺伝子配列により、代表的な15検体がインドの2018年版WSSV株と100％同一であることが確認された。危険因子、有病率や重症度、WSSV株の由来などの関係は、WSD管理にとってインパクトのあるものになると思われる。

White spot disease has caused significant economic losses in the shrimp farming industry of Bangladesh over the last two decades. The responsible virus, WSSV, may show severe disease with significant mortality depending on farm management and environmental and seasonal changes. Data on farm management and environmental parameters were collected from the southwest region of Bangladesh in 2018, and WSSV infection was confirmed by the species-specific gene VP28 using conventional PCR, real-time PCR and sequencing. Through bivariate analysis, nine significant risk factors for WSD were identified, viz. farm age, presence of nursery pond, reservoir of PL, weed in farm area, control of weed, stocking density, stocking frequency, ammonia and oxygen concentration. This study detected 46 WSSV-infected shrimp farms by conventional PCR, whereas real-time PCR identified 47 WSSV-positive out of 49 farms. WSSV prevalence was highest in the Khulna region, with 100% positivity in all seasons. WSSV loads ranged from 5.62 × 10 to 2.01 × 10 copies/g of shrimp tissue. The VP28 gene sequence confirmed that 15 representative samples were 100% identical to the 2018 WSSV strain of India. The relationships among risk factors, prevalence and severity of disease, and origin of WSSV strains could be impactful for WSD management.