既知の細菌タンパク質ワクチン抗原の分析により、偏った物理的性質とアミノ酸組成が明らかになりました

Analysis of known bacterial protein vaccine antigens reveals biased physical properties and amino acid composition.

• Carl Mayers
• Melanie Duffield
• Sonya Rowe
• Julie Miller
• Bryan Lingard
• Sarah Hayward
• Richard W Titball

抄録

多くのワクチンは、細菌性病原体を生きたまま減衰させたものや、死滅した細菌細胞から開発されてきました。しかし、ワクチン接種後の一過性の副作用の可能性についての認識が高まっていることから、全細菌細胞をベースにしたワクチンよりも、サブユニットワクチンの使用に重点が置かれるようになっています。ワクチンのサブユニットの同定には時間がかかることが多く、最近ではバイオインフォマティクスのアプローチがタンパク質ワクチンの候補抗原を同定するために使用されています。このような方法は、最終的にはワクチンの前臨床研究に向けて、より迅速に前進することを約束します。私たちは、ランダムに選択されたタンパク質に対する既知の細菌ワクチン抗原の特性を比較し、これらの2つのグループの構成の違いを同定しました。これらの違いを利用したコンピュータアルゴリズムにより、病原性細菌のワクチン抗原候補を、そのアミノ酸組成に基づいて同定することが可能になりました。

Many vaccines have been developed from live attenuated forms of bacterial pathogens or from killed bacterial cells. However, an increased awareness of the potential for transient side-effects following vaccination has prompted an increased emphasis on the use of sub-unit vaccines, rather than those based on whole bacterial cells. The identification of vaccine sub-units is often a lengthy process and bioinformatics approaches have recently been used to identify candidate protein vaccine antigens. Such methods ultimately offer the promise of a more rapid advance towards preclinical studies with vaccines. We have compared the properties of known bacterial vaccine antigens against randomly selected proteins and identified differences in the make-up of these two groups. A computer algorithm that exploits these differences allows the identification of potential vaccine antigen candidates from pathogenic bacteria on the basis of their amino acid composition, a property inherently associated with sub-cellular location.