キューバ産Trichomonas vaginalisウイルス3種の遺伝的特徴。トチビル科の系統図

Genetic characterization of three Cuban Trichomonas vaginalis virus. Phylogeny of Totiviridae family.

• Jorge Fraga
• Lazara Rojas
• Idalia Sariego
• Ayme Fernández-Calienes

抄録

トリコモナス膣炎は、T. vaginalisウイルス（TVV）として知られる二本鎖RNA（dsRNA）ウイルスに感染することができる。このウイルス感染は、トリコモナスウイルスの病原性や疾患の発症に重要な意味を持つ可能性がある。本研究では、キューバのT. vaginalisから分離されたTVVの3つの株を同定し、遺伝学的特徴付けを行った。その結果、新たに予測されたキャプシドタンパク質とRNA依存性RNAポリメラーゼの配列は、これまでに決定された20種のTVVの配列に相当し、その他のTotiviridae科の21種のウイルスを系統解析に使用した。系統樹には、4つの異なる単系統のクラッドが示されている。1つはTVV、他の1つはビクトリウイルス、ライシュマニアウイルス、エイメリア・ブルネッティウイルス、他の1つはトティウイルス属のウイルス、最後の1つはジアルディウイルスである。E. ブルネッティウイルスは、系統樹の中では、リーシュマニアウイルスとビクトリウイルスの間で独立した分類群として同定されており、ビクトリウイルスに最も密接に関連している。TVVはTotiviridae科の他のウイルスと区別できる単系統のクラスターを構成していることがわかった。このことから，TVVはGiardiavirusの中ではなく，別属に属している可能性が示唆された．TVVは，ジアルディウイルスやトチウイルスに属する他の原生動物や真菌類のウイルスよりも，ライシュマニアウイルス属の原生動物ウイルスやビクトリウイルス属の真菌類の方が近縁であるように思われた．TVVの中では，トリコモナスウイルス群の中に主に4つのグループが認められ，これまで提案されていた種の分類と一致している．トリコモナスウイルス属間の系統関係を明らかにするためには、より多くのTVV株、特にTVV3とTVV4を用いた研究が必要であり、TVV2とTVV3がそれぞれ十分に限定されたグループを構成しているかどうかを明らかにする必要がある。

Trichomonas vaginalis can be infected with double stranded RNA (dsRNA) viruses known as T. vaginalis virus (TVV). This viral infection may have important implications for trichomonal virulence and disease pathogenesis. In this study we identified and genetic characterized three strains of TVVs isolated from T. vaginalis in Cuba. The three new predicted sequences of capsid protein and RNA-dependent RNA polymerase amounted to the previously determined 20 TVV sequences and other 21 viruses of Totiviridae family were used for a phylogenetic analysis. Four distinct monophyletic clades are shown in a phylogenetic tree. One corresponds with TVVs, other with Victorivirus, Leishmaniavirus and Eimeria brunetti virus and, other with viruses of the genus Totivirus and the last with Giardiavirus. The E. brunetti virus is identified in the phylogenetic tree as independent taxon between Leishmaniavirus and Victorivirus isolates, most closely related to Victorivirus. TVV constitute a monophyletic cluster distinguishable from all other viruses in Totiviridae family. This result suggested that TVV may be grouped in a separated genus and not inside of Giardiavirus. TVVs appear to be more closely related to protozoan viruses in the genus Leishmaniavirus and to fungal viruses in the genus Victorivirus than to other protozoan and fungal viruses in Giardiavirus and Totivirus. Among TVVs, four main groups can be recognized within Trichomonasvirus cluster, which correspond with the previous species classification proposed. Further studies, with more TVV strains, especially TVV3 and 4 strains, are needed in order to determine the phylogenetic relationship among Trichomonasvirus genus and specifically if TVV2 and 3 each also constitute a well-delimited group.

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