Porphyromonas gingivalisからのIX型分泌系の構成要素であるPorMの異なる構築物の結晶化シャペロンとして使用されたカメロイドナノボディ

Camelid nanobodies used as crystallization chaperones for different constructs of PorM, a component of the type IX secretion system from Porphyromonas gingivalis.

• Yoan Duhoo
• Jennifer Roche
• Thi Trang Nhung Trinh
• Aline Desmyter
• Anaïs Gaubert
• Christine Kellenberger
• Christian Cambillau
• Alain Roussel
• Philippe Leone

抄録

PorM は、ヒトの歯周病の原因となる主要な細菌病原体である Porphyromonas gingivalis の IX 型分泌系（T9SS）の組み立てに関与する膜タンパク質である。PorMの構造研究の一環として、4種類のカメロイドナノボディを選択、製造、精製し、PorMのペリプラズミックドメインのN末端またはC末端部分との特異的な相互作用を調べました。また、回折結晶も得られ、4つのナノボディの構造を分子置換により解いた。さらに、2つのナノボディを結晶化シャペロンとして使用し、PorMのペリプラズミックドメインの構造決定プロセスにおいて貴重なツールであることが判明した。

PorM is a membrane protein that is involved in the assembly of the type IX secretion system (T9SS) in Porphyromonas gingivalis, a major bacterial pathogen that is responsible for periodontal disease in humans. In the context of structural studies of PorM to better understand T9SS assembly, four camelid nanobodies were selected, produced and purified, and their specific interaction with the N-terminal or C-terminal part of the periplasmic domain of PorM was investigated. Diffracting crystals were also obtained, and the structures of the four nanobodies were solved by molecular replacement. Furthermore, two nanobodies were used as crystallization chaperones and turned out to be valuable tools in the structure-determination process of the periplasmic domain of PorM.