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日本人統合失調症患者の血液試料を用いたエピジェネティック時計解析
Epigenetic clock analysis of blood samples from Japanese schizophrenia patients.
PMID: 30814520
抄録
精神分裂病(SCZ)の老化促進仮説が提唱されている。DNAメチル化プロファイルは "エピジェネティック年齢 "を決定するために開発された。ここでは、SCZにおける内因性エピジェネティック加齢加速と外因性エピジェネティック加齢加速(それぞれIEAAとEEAA)を評価した。日本人を祖先とする2つの独立したコホートを検討した。1つ目のコホートは、長期入院または反復入院中のSCZ患者80人と対照者40人からなり、経済的なDNAプーリング法を用いた。もう1つのコホートは、無投薬のSCZ患者24人と対照者23人である。SCZ患者の血液は、最初のコホートではEEAAの減少を認めたが(p=0.0162)、2番目のコホートでは認められなかった。IEAAはどちらのコホートでも差がなかった。我々は、一般に入手可能なヨーロッパ系血統のデータセット(3つの血液データセットと1つの脳データセット)を用いて再現解析を行った。1つの血液データセットでは、SCZにおいてEEAAが増加していた(p=0.0228)。全体として、本結果は、日本人集団における入院に関連したSCZにおけるEEAAの減少の証拠を提供する。
The accelerated aging hypothesis of schizophrenia (SCZ) has been proposed. DNA methylation profiles were developed for determining "epigenetic age." Here, we assessed intrinsic and extrinsic epigenetic age acceleration (IEAA and EEAA, respectively) in SCZ. We examined two independent cohorts of Japanese ancestry. The first cohort consisted of 80 patients with SCZ under long-term or repeated hospitalization and 40 controls, with the economical DNA pooling technique. The second cohort consisted of 24 medication-free patients with SCZ and 23 controls. Blood of SCZ subjects exhibited decreased EEAA in the first cohort (p = 0.0162), but not in the second cohort. IEAA did not differ in either cohort. We performed replication analyses using publicly available datasets from European ancestry (three blood and one brain datasets). One blood dataset showed increased EEAA in SCZ (p = 0.0228). Overall, our results provide evidence for decreased EEAA in SCZ associated with hospitalization in the Japanese population.