チリ・サンティアゴの廃水における1年間のサーベイランスにおけるJCポリオマウイルスの循環

JC polyomavirus circulation in one-year surveillance in wastewater in Santiago, Chile.

• Jorge Levican
• Arturo Levican
• Manuel Ampuero
• Aldo Gaggero

抄録

ヒトポリオマウイルスJC（JCPyV）は広く分布しているウイルスであり，環境条件に対する耐性が高いことから，多様な水源からの回収が頻繁に行われており，人体汚染の指標とされている．世界各地で分離されたJCPyVの系統解析を行った結果、7つの遺伝子型が明らかになり、特定の集団や民族に関連していることが明らかになった。この特徴は、世界各地の先史時代や歴史的な人の移動パターンを追跡するのに利用されてきた。世界各地で遺伝子型の分布が報告されているが、南米最南端のJCPyVの遺伝子型に関するデータは少ない。本研究の目的は，チリのサンティアゴで循環しているJCPyVを，下水処理場（WWTP）から採取した汚水サンプルを用いて検出し，その特徴を明らかにすることである．チリのサンティアゴ市で発生する廃水の約80％を処理する3つのWWTPから1年間毎月下水サンプルを採取した。その結果、JCPyVは80.56％のサンプルから検出されたことから、チリのサンティアゴ市に多く分布していることがわかり、JCPyVは人間環境汚染を評価するためのマーカーとして利用できることが明らかになった。JCPyVは流入水および排水サンプルから高頻度で検出され、最大のWWTPでは検出率とウイルス負荷が最も高かった。系統解析では、チリの配列は主に遺伝子型2A（アジア型）にクラスタリングされていた。これは、以前にアルゼンチンのブエノスアイレスで報告されたものと類似しており、ヨーロッパの亜型1と4、アフリカの亜型3と6の循環が記述されているブラジルのデータとは乖離している。

Human polyomavirus JC (JCPyV) is a widely distributed viral agent and because it high resistance against environmental conditions it is frequently recovered from diverse sources of water and is considered a good marker for human pollution. Phylogenetic analysis of JCPyV isolated in different part of the world has revealed 7 genotypes, which have been associated with specific populations or ethnics groups. This feature has been used to trace pre-historic and historic human migration patterns across the world. Although there are many reports describing genotypes distribution around the world, data on JCPyV genotypes in the southernmost areas of South America are scarce. The goal of this study is to detect and characterize the JCPyV that circulates in Santiago, Chile using sewage samples from wastewater treatment plants (WWTP). Sewage samples were obtained monthly during 1 year from three WWTPs which together process about 80% of wastewater generated in the city of Santiago, Chile. Our results show that JCPyV profusely circulates in Santiago, Chile, because it was detected in 80.56% of the samples, reinforcing the use of JCPyV as a feasible marker to assess human environmental pollution. JCPyV was detected in high frequency in influents and effluents samples, with the largest WWTPs showing the highest percentage of detection and viral loads. In the phylogenetic analysis the Chilean sequences clustered mainly with genotype 2A (Asian genotype). This is similar to that previously reported from Buenos Aires, Argentina and divergent to data from Brazil, where the circulation of European subtypes 1 and 4 and African subtypes 3 and 6 has been described.

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