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日本語AIでPubMedを検索

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PLoS ONE.2019;14(4):e0214611. PONE-D-18-36441. doi: 10.1371/journal.pone.0214611.Epub 2019-04-11.

大腸がんI-III期患者におけるCXCサブファミリーリガンドの予後予測値

The prognostic value of CXC subfamily ligands in stage I-III patients with colorectal cancer.

  • Xiangde Li
  • Qiulu Zhong
  • Danjing Luo
  • Qinghua Du
  • Wenqi Liu
PMID: 30973890 PMCID: PMC6459597. DOI: 10.1371/journal.pone.0214611.

抄録

目的:

大腸がんI~III期患者におけるCXCサブファミリーリガンドの価値を調査し、CRC患者の新たな予測因子を見つけること。

OBJECTIVE: To investigate the value of CXC subfamily ligands in stage I-III patients with colorectal cancer, in order to find a new predictor for CRC patients.

方法:

CXCサブファミリーリガンドの遺伝子発現とそれに対応する臨床データを収集するために、Gene Expression Omnibus (GEO)データベースを使用した。生存解析はRsoftwareの"survival"パッケージを用いて行った。CRC患者のDFSとCXCサブファミリーリガンドの発現レベルの関係を一変量Cox回帰分析で評価した。

METHODS: We used Gene Expression Omnibus (GEO) database to collect the gene expression of CXC subfamily ligands and corresponding clinical data. The survival analysis was performed by "survival" package of Rsoftware. The CRC patients' DFS and the relationship between the expression levels of CXC subfamily ligands were evaluated by the univariate Cox regression analysis.

結果:

マイクロアレイデータを用いて、データセットGSE39582から14個のCXCサブファミリーリガンドが同定された。7つのCXCサブファミリーリガンドはCRC患者のDFSと有意に相関していた。CXCL1、CXCL3、CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL13、CXCL14を含む7つのCXCサブファミリーリガンドは、CRC患者のDFSと有意な相関を示しました(p<0.05)。多変量Cox回帰分析の結果、4つのCXCサブファミリーリガンド(CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL13)はCRC患者のDFSと有意に関連していました(いずれもp<0.05)。3つのCXCサブファミリーリガンド(CXCL10、CXCL11、CXCL13)は、CRC患者の全生存期間(OS)と有意に関連していました(すべてp<0.05)。CXCL11とCXCL13はいずれもDFSとOSの予測値は同等でした。

RESULTS: By using microarray data, there were 14 CXC subfamily ligands identified from dataset GSE39582. Seven CXC subfamily ligands were significantly correlated with DFS in CRC patients. (p<0.05),including CXCL1, CXCL3, CXCL9, CXCL10, CXCL11, CXCL13, and CXCL14. From multivariate Cox regression analyze, four CXC subfamily ligands (CXCL9, CXCL10, CXCL11, and CXCL13) were significantly associated with CRC patients' DFS (all p<0.05). Three CXC subfamily ligands (CXCL10, CXCL11, and CXCL13) were significantly associated with CRC patients' Overall survival (OS) (all p<0.05). Both CXCL11 and CXCL13 had the similar prediction values for DFS and OS.

結論:

CRC患者のDFSと有意に相関するCXCサブファミリーリガンドは7つありました。4つのCXCサブファミリーリガンド(CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL13)と3つのCXCサブファミリーリガンド(CXCL10、CXCL11、CXCL13)の発現レベルの違いは、CRC患者のDFSとOSに関連していた。これらの結論を確認するためには、まだまだ実験が必要である。次のステップとして、CXCサブファミリーリガンドの予測値を検証するために、これらの遺伝子について動物実験を行う予定です。

CONCLUSION: There were seven CXC subfamily ligands were significantly correlated with DFS in CRC patients. Different expression level of four CXC subfamily ligands (CXCL9, CXCL10, CXCL11, and CXCL13) and Three CXC subfamily ligands (CXCL10, CXCL11, and CXCL13) were related to CRC patients' DFS and OS. There are still needs more experiments to confirm our conclusions. Next step we will make animal experiment about the genes in order to verified the predictive value of the CXC subfamily ligands.