子宮筋腫を有するアフロカリブ女性集団におけるCYP1B1およびCCDC57遺伝子のハプロタイプ

Haplotypes of CYP1B1 and CCDC57 genes in an Afro-Caribbean female population with uterine leiomyoma.

• Angela T Alleyne
• Virgil S Bideau

抄録

子宮筋腫（UL）は、特にアフリカ系の女性の間で流行している良性腫瘍である。また、この疾患は遺伝的責任を有し、ホルモンや肥満などの危険因子の影響を受けている。本研究では、アフロカリブ系女性におけるホルモンに関連するチトクロームP450 1B1遺伝子（CYP1B1）と肥満に関連するコイルドコイルドメイン含有57遺伝子（CCDC57）のハプロタイプを調査した。各ハプロタイプはPHASE v.2.1ソフトウェアを用いて非位相配列データから構築し、連結不平衡（LD）調査にはHaploview v.4.2を用いた。CYP1B1とCCDC5の一塩基多型の間には、対照的なLDが観察された。その結果、CYP1B1のGTAハプロタイプはULリスクと有意に関連していた（P=0.02）が、CCDC57ハプロタイプのATGハプロタイプではULリスクとの関連は認められなかった（P=0.2）。このように、我々の知見は、CYP1B1のAsp449Asp多型とGTAハプロタイプが、この集団のアフロ・カリブ系祖先の女性におけるUL感受性に寄与している可能性を示唆している。

Uterine leiomyomas (UL) are prevalent benign tumors, especially among women of African ancestry. The disease also has genetic liability and is influenced by risk factors such as hormones and obesity. This study investigates the haplotypes of the Cytochrome P450 1B1 gene (CYP1B1) related to hormones and coiled-coil domain containing 57 gene (CCDC57) related to obesity in Afro-Caribbean females. Each haplotype was constructed from unphased sequence data using PHASE v.2.1 software and Haploview v.4.2 was used for linkage disequilibrium (LD) studies. There were contrasting LD observed among the single nucleotide polymorphisms of CYP1B1 and CCDC5. Accordingly, the GTA haplotype of CYP1B1 was significantly associated with UL risk (P = 0.02) while there was no association between CCDC57 haplotypes and UL (P = 0.2) for the ATG haplotype. As such, our findings suggest that the Asp449Asp polymorphism and GTA haplotype of CYP1B1 may contribute to UL susceptibility in women of Afro-Caribbean ancestry in this population.