TruSight One「クリニカルエクソーム」遺伝子パネルを用いた網膜芽細胞腫の新規候補遺伝子の探索

Investigation of new candidate genes in retinoblastoma using the TruSight One "clinical exome" gene panel.

• Demet Akdeniz
• Seref Bugra Tuncer
• Rejin Kebudi
• Betul Celik
• Gozde Kuru
• Seda Kilic
• Ozge Sukruoglu Erdogan
• Mukaddes Avsar
• Sema Buyukkapu Bay
• Samuray Tuncer
• Hulya Yazici

抄録

背景:

網膜芽細胞腫（Rb）は、網膜の最も有病率の高い小児眼内悪性腫瘍である。重要な遺伝的因子がRbの発生に関与していることが知られています。

BACKGROUND: Retinoblastoma (Rb) is the most prevalent intraocular pediatric malignancy of the retina. Significant genetic factors are known to have a role in the development of Rb.

方法:

ここでは、本研究でRb発症リスクの高い3家族から、RB1遺伝子変異の非キャリアでRB1プロモーターメチル化が正常な6例の臨床的に有意な4813遺伝子の変異状況を報告する。

METHODS: Here, we report the mutation status of 4813 clinically significant genes in six patients with noncarrier of RB1 gene mutation and having normal RB1 promoter methylation from three families having higher risk for developing Rb in the study.

結果:

本研究では、合計27の変異体が検出された。FGFR4遺伝子のc.1162G>A (p.Gly388Arg)、NQO1遺伝子のc.559C>T (p.Pro187Ser)のヘテロ接合型ミスセンス変異体が同定された。ファミリーベースの評価により、第一ファミリーのCLEC7A遺伝子の変異体c.714T>G (p.Tyr238Ter)、APOC3遺伝子の変異体c.55C>T (p.Arg19Ter)、および変異体c.1171第2家族のMUTYH遺伝子のC>T (p.Gln391Ter)、第3家族のUGT1A1遺伝子の変異体c.211G>A (p.Gly71Arg)は、統計学的に有意であった(p<0.05)。

RESULTS: A total of 27 variants were detected in the study. Heterozygous missense variants c.1162G > A (p.Gly388Arg) in the FGFR4 gene; c.559C > T (p.Pro187Ser) in the NQO1 gene were identified. The family based evaluation of the variants showed that the variant, c.714T > G (p.Tyr238Ter), in the CLEC7A gene in first family; the variant, c.55C > T (p.Arg19Ter), in the APOC3 gene and the variant, c.1171C > T (p.Gln391Ter), in the MUTYH gene in second family; and the variant, c.211G > A (p.Gly71Arg), in the UGT1A1 gene in the third family, were found statistically significant (p < 0.05).

結論:

本研究は、RB1遺伝子に変異がなく、Rb発症のリスクが高い患者の他の遺伝子の変異状況を明らかにする上で重要な報告であると考えられる。また、レチノイン酸経路とRb発がんとの相互作用を初めて明らかにした。

CONCLUSION: This study might be an important report on emphazing the mutational status of other genes in patients without RB1 gene mutations and having high risk for developing Rb. The study also indicates the interaction between the retinoic acid pathway and Rb oncogenesis for the first time.

© 2019 The Authors. Molecular Genetics & Genomic Medicine published by Wiley Periodicals, Inc.