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イランの頭頸部癌患者における口腔咽頭カンジダ症から分離されたCandidaalbicansの遺伝子型解析。分子疫学とSAP2遺伝子発現
Genotyping of Candidaalbicans isolates from oropharyngeal candidiasis in head and neck cancer patients in Iran: Molecular epidemiology and SAP2 gene expression.
PMID: 31630914 DOI: 10.1016/j.mycmed.2019.100896.
抄録
目的:
Multilocus sequence typingは、Candidaalbicansの臨床分離株のジェノタイピングのための強力な方法である。患者間の交差汚染は院内感染の重要な原因である。テヘラン癌研究所では、C.albicansによる口咽頭カンジダ症(OPC)が頭頸部癌患者の重要な問題となっている。ここでは、C.albicans分離株の固有遺伝子型とその地理的分布、交差汚染の可能性、口腔カンジダ症で重要な遺伝子であるSAP2遺伝子の発現との関係をMLST群を用いて検討した。
OBJECTIVE: Multilocus sequence typing is a powerful method for genotyping of clinical isolates of Candidaalbicans. Cross-contamination between the patients is an important reason for nosocomial infections. Oropharyngeal candidiasis (OPC) caused by C. albicans is an important problem in patients with head and neck cancer, in Cancer Institute of Tehran. Here we studied the endemic genotypes of C. albicans isolates and the relationship between geographic distributions, potential cross-contaminations and the expression of SAP2 gene, an important gene in oral candidiasis, with MLST groups.
材料と方法:
口咽頭カンジダ症を有する頭頸部癌患者から分離されたC.albicansの臨床株32株をMLST解析の対象とし、リアルタイムPCRによるSAP2遺伝子発現解析を行った。
MATERIAL AND METHODS: A total of 32 clinical strains of C. albicans isolated from head and neck cancer patients with oropharyngeal candidiasis were subjected to MLST analysis and SAP2 gene expression was analyzed by Real-time PCR.
結果:
C.albicans分離株の7遺伝子座における75の多型部位と30の二倍体配列型を同定し、そのうち27部位が新規に発見された。eBURST解析の結果、CC124が全CCの中で最も有病率が高いグループであることが判明した。また、SAP2遺伝子は対照群と比較して、ほぼ全てのOPC患者の分離株で高発現を示した。
RESULTS: We identified 75 polymorphic sites in 7 loci of C. albicans isolates and 30 diploid sequence types which 27 of them were found as new. After eBURST analysis, our results determined that CC 124 was the most prevalent group among all CCs. SAP2 gene showed high expression in almost all OPC patients' isolates, compared to the control.
結論:
また、32株のカンジダ菌の中には、遺伝的に関連性のあるものや同一性のあるものはほとんど見られず、患者間の交差汚染が少ないことが示唆された。C.albicansのMLSTプロファイルと患者の地理的分布、癌の種類およびSAP2遺伝子発現との間には相関関係はなかった。このような相関関係の欠如は、研究対象となる患者数が少ないことに起因している可能性があり、より多くの関連性を見いだすためには、より多くのサンプル数の研究が必要である。
CONCLUSION: We found few genetically-related as well as identical isolates among the 32 Candida strains which indicated low cross-contaminations among the patients. There was no relationship between C. albicans MLST profiles and their geographic distribution, cancer type and SAP2 gene expression. This lack of correlation was possibly due to the small understudy population; hence, finding more relevance requires studies with a higher number of samples.
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