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オープンソースの自動化された腫瘍浸潤リンパ球アルゴリズムによるメラノーマの予後診断
An open source automated tumor infiltrating lymphocyte algorithm for prognosis in melanoma.
PMID: 31784511 PMCID: PMC6884485. DOI: 10.1038/s41467-019-13043-2.
抄録
メラノーマの予後因子としての腫瘍浸潤リンパ球（TIL）の評価は、標準化されていないため、広く採用されていない。自動化が解決策となる可能性がある。ここでは、オープンソースのソフトウェアを使用して、メラノーマのヘマトキシリン・エオジン染色切片上のTILの画像ベースの自動評価のためのアルゴリズムを構築します。2つの機関からの4つの独立したコホート、1つのトレーニングセット（N=227）と3つの検証コホート（N=137、N=201、N=76）からなる641人のメラノーマ患者のレトロスペクティブコレクションを用いて、自動TILスコアリングアルゴリズムが患者を予後良好なコホートと予後不良なコホートに分離し、TILのスコアが高いほど予後良好と関連していることを示した。多変量解析では、自動化されたTILスコアは、疾患特異的な全生存期間と独立した関連を示す。したがって、オープンソースの自動化されたTILスコアリングは、メラノーマにおける独立した予後マーカーである。さらなる研究により、このアルゴリズムは、免疫療法を免れる可能性のある患者のサブセットを定義するのに有用であると考えられる。
Assessment of tumor infiltrating lymphocytes (TILs) as a prognostic variable in melanoma has not seen broad adoption due to lack of standardization. Automation could represent a solution. Here, using open source software, we build an algorithm for image-based automated assessment of TILs on hematoxylin-eosin stained sections in melanoma. Using a retrospective collection of 641 melanoma patients comprising four independent cohorts; one training set (N = 227) and three validation cohorts (N = 137, N = 201, N = 76) from 2 institutions, we show that the automated TIL scoring algorithm separates patients into favorable and poor prognosis cohorts, where higher TILs scores were associated with favorable prognosis. In multivariable analyses, automated TIL scores show an independent association with disease-specific overall survival. Therefore, the open source, automated TIL scoring is an independent prognostic marker in melanoma. With further study, we believe that this algorithm could be useful to define a subset of patients that could potentially be spared immunotherapy.