肺腺癌の過剰発現は、生存率低下の新たな独立した予後マーカーである

Overexpression of in Lung Adenocarcinoma Is a New Independent Prognostic Marker of Poor Survival.

• Dan Wang
• Yichen Jia
• Wendan Zheng
• Changzheng Li
• Wen Cui

抄録

真核生物の翻訳開始因子3（eIF3）は、哺乳類細胞の中で最大かつ最も複雑な翻訳開始因子である。eIF3は13個のサブユニットから構成されており、そのうちのいくつかは複数のヒト癌の予後に重要な影響を及ぼすことが示唆されている。肺腺癌（LUAD）患者におけるサブユニットの発現プロファイルを調べ、その予後を明らかにするために、The Cancer Genome Atlas（TCGA）プロジェクトからゲノムデータ、生存期間データ、関連臨床情報を取得し、二次解析を行った。その結果、隣接する正常な腫瘍と比較して腫瘍内で異常に発現した10個のサブユニットのうち（<0.05）、アップレギュレーションされたもののみが、複数の臨床病理学的パラメータとは無関係に、不良な全生存（OS）転帰を予測できることが示された（HR = 2.043、95% CI: 1.132-3.689、= 0.018）。カイ二乗解析の結果、高発現群では、病理学的病期が進行している患者の比率が高く（68/40 vs. 184/206、＝0.0046）、残存腫瘍（13/4 vs. 163/176、＝0.0257）、標的分子治療（85/65 vs. 138/164、＝0.0357）、また、高発現群の患者の比率が高いことが明らかになった。の発現の変化は、少なくともコピー数の変化（CNA）とcg14297023部位のハイメチル化の両方によって制御されていることが、インシリコ解析で実証された。結論として、高発現はLUAD患者の短いOSの貴重な独立した予後指標となる可能性がある。

The eukaryotic initiation factor 3 (eIF3) is the largest and most complex translation initiation factor in mammalian cells. It consists of 13 subunits and among which several were implicated to have significant prognostic effects on multiple human cancer entities. To examine the expression profiles of subunits and determine their prognostic value in patients with lung adenocarcinoma (LUAD), the genomic data, survival data, and related clinical information were obtained from The Cancer Genome Atlas (TCGA) project for a secondary analysis. The results showed that among ten aberrantly expressed subunits in tumours compared with adjacent normal counterparts ( < 0.05), only upregulated could predict poor overall survival (OS) outcome independent of multiple clinicopathological parameters (HR = 2.043, 95% CI: 1.132-3.689, = 0.018). Chi-square analysis revealed that the highly expressed group had larger ratios of patients with advanced pathological stage (68/40 vs. 184/206, = 0.0046), residual tumour (13/4 vs. 163/176, = 0.0257), and targeted molecular therapy (85/65 vs. 138/164, = 0.0357). In silico analysis demonstrated that the altered expression of was at least regulated by both copy number alterations (CNAs) and the hypomethylation of cg14297023 site. In conclusion, high expression might serve as a valuable independent prognostic indicator of shorter OS in patients with LUAD.

Copyright © 2019 Dan Wang et al.