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ガーナ人集団における抗レトロウイルス感染HIV患者における一塩基多型と脂質異常症との関連。ケースコントロール研究
Association of single nucleotide polymorphisms with dyslipidemia in antiretroviral exposed HIV patients in a Ghanaian population: A case-control study.
PMID: 31929604 PMCID: PMC6957303. DOI: 10.1371/journal.pone.0227779.
抄録
脂質異常症は、抗レトロウイルス療法（ART）の長期使用に伴う合併症の一つであり、遺伝的要因との関連性も知られている。ガーナでARTを受けているHIV感染者の脂質異常症と関連する宿主遺伝的変異については、まだ十分な検討がなされていない。本研究では、少なくとも1年間安定したARTを受けているHIV感染者289人を対象とした。脂質測定のために空腹時血液をEDTAチューブに採取した。脂質プロファイルは、NCEP-ATP III基準に基づいて脂質異常症を定義するために使用された。HIV感染者は、脂質異常症（症例）（n = 90、31.1％）と脂質異常症なし（対照）（n = 199、68.9％）の2つのグループに分類された。4つの一塩基多型（SNP）候補遺伝子（ABCA1-rs2066714、LDLR-rs6511720、APOA5-rs662799、DSCAML1-rs10892151）を決定した。遺伝子型決定は、試験参加者の単離されたゲノムＤＮＡに対して、ＰＣＲに続いてマルチプレックスライゲーション検出反応（ＬＤＲ）を用いて行った。その結果、症例では、rs6511720（T/T）、rs2066714（G/G）、rs10892151（T/T）、rs662799（G/G）のまれなホモ接合対立遺伝子を持つ集団の割合は5.5％、14.4％、6.6％、10.0％であったのに対し、対照群では2.0％、9.1％、6.5％、4.0％であった。APOA5遺伝子型（p＝0.0357）とLDLR多型（p＝0.0387）の遺伝子型有病率には、症例被験者と対照被験者の間で統計学的に有意な差が認められた。APOA5多型のAA遺伝子型と比較して、まれなホモ接合遺伝子型［aOR＝2.38、95％CI（1.06～6.54）、p＝0.004］を有する個体は、年齢、性別、治療期間、CD4カウント、BMIをコントロールした後、脂質異常症を発症する可能性の増加と有意に関連していた。さらに、ABCA1（G/G）[aOR = 10.7(1.3-88.7), p = 0.0280]およびLDLR（rs6511720）G>T [aOR = 61.2(7.6-493.4), p<0.0001]のまれなホモ接合遺伝子型を持つ個体は、総コレステロール値が高い可能性が高かった。我々のデータは、ガーナの集団でARTに曝されたHIV患者における4つの候補遺伝子のSNPの存在と脂質異常症との関連性、特にAPOA5-rs662799とLDLR rs6511720のバリアントの存在を強調している。これらの知見は、ART治療を受けたHIV患者の脂質異常症をモニタリングするためには、事前に症状を把握しておく必要があることを示している。今後、包括的な数のSNPと脂質異常症との関連を検証するための縦断的研究が必要である。
Dyslipidemia is a potential complication of long-term usage of antiretroviral therapy (ART) and also known to be associated with genetic factors. The host genetic variants associated with dyslipidemia in HIV patients on ART in Ghana have not been fully explored. The study constituted a total of 289 HIV-infected patients on stable ART for at least a year. Fasting blood was collected into EDTA tube for lipids measurement. Lipid profiles were used to define dyslipidemia based on the NCEP-ATP III criteria. HIV-infected subjects were categorized into two groups; those with dyslipidemia (cases) (n = 90; 31.1%) and without dyslipidemia (controls)(n = 199; 68.9%). Four candidate single nucleotide polymorphism (SNP) genes (ABCA1-rs2066714, LDLR-rs6511720, APOA5-rs662799 and DSCAML1-rs10892151) were determined. Genotyping was performed on isolated genomic DNA of study participants using PCR followed by a multiplex ligation detection reaction (LDR). The percentage of the population who had the rare homozygote alleles for rs6511720 (T/T), rs2066714 (G/G), rs10892151 (T/T) and rs662799 (G/G) among case subjects were 5.5%, 14.4%, 6.6% and 10.0% whiles 2.0% 9.1%, 6.5% and 4.0% were observed among control subjects. There were statistically significant differences in the genotypic prevalence of APOA5 (p = 0.0357) and LDLR polymorphisms (p = 0.0387) between case and control subjects. Compared to the AA genotype of the APOA5 polymorphisms, individuals with the rare homozygote genotype [aOR = 2.38, 95%CI(1.06-6.54), p = 0.004] were significantly associated with an increased likelihood of developing dyslipidemia after controlling for age, gender, treatment duration, CD4 counts and BMI. Moreover, individuals with the rare homozygous genotype of ABCA1 (G/G) [aOR = 10.7(1.3-88.7), p = 0.0280] and LDLR (rs6511720) G>T [aOR = 61.2(7.6-493.4), p<0.0001) were more likely to have high levels of total cholesterol levels. Our data accentuate the presence of SNPs in four candidate genes and their association with dyslipidemia among HIV patients exposed to ART in the Ghanaian population, especially variants in APOA5-rs662799 and LDLR rs6511720 respectively. These findings provide baseline information that necessitates a pre-symptomatic strategy for monitoring dyslipidemia in ART-treated HIV patients. There is a need for longitudinal studies to validate a comprehensive number of SNPs and their associations with dyslipidemia.