チベットの放牧地から分離されたMyroides odoratimimusにおける移動可能な多剤耐性ゲノム島の同定

Identification of a mobilizable, multidrug-resistant genomic island in Myroides odoratimimus isolated from Tibetan pasture.

• Peipei Zhang
• Meng Liu
• Jiafang Fu
• Chuanqing Zhong
• Gongli Zong
• Guangxiang Cao

抄録

環境細菌Myroides odoratimimusの株は、ヒトに感染症を引き起こす可能性がある。しかし，本菌は多剤耐性を有しているため，感染症の治療は困難である。本研究では，中国チベットの放牧地からM. odoratimimus G13株を分離した。最小阻害濃度解析の結果，G13株は多剤耐性を有しており，テトラサイクリンに対するMICは168mg/Lであった。全ゲノムシークエンスとバイオインフォマティクス解析の結果，G13株のゲノムにはウイルス性因子をコードする遺伝子と抗生物質耐性遺伝子（ARG）が豊富に含まれていることが明らかになった。また、動員可能なゲノム島MGI1313を同定・解析し、4種類の抗生物質に関連する6つの耐性遺伝子をMGI1313にアノテーションした。コンジュゲーションアッセイの結果、MGI1313はG13から大腸菌25DNに水平遺伝子導入され、多剤耐性大腸菌コンジュゲートが得られることが示された。結論として，多剤耐性M. odoratimimus G13とMGI1313の移動性は，難治性細菌感染症のリスクを高め，厳重なサーベイランスが必要であると考えられた。

Strains of the environmental bacterium Myroides odoratimimus can cause human infections. However, treating M. odoratimimus infections can be difficult because of multidrug resistance in this organism. In this study, we isolated strain M. odoratimimus G13 from pastureland in Tibet, China. The minimum inhibitory concentration analysis suggested that strain G13 has resistance to multiple antibiotics, with an MIC for tetracycline of 168 mg/L. Whole-genome sequencing and bioinformatic analysis revealed that the genome of G13 was rich in virulence factor-encoding genes and antibiotic resistance genes (ARGs). The mobilizable genomic island MGI1313 was also identified and characterized, and six resistance genes related to four types of antibiotics were annotated in MGI1313. Conjugation assays indicated that MGI1313 could be transferred from G13 to Escherichia coli 25DN by horizontal gene transfer, resulting in multidrug-resistant E. coli conjugants. In conclusion, multidrug-resistant M. odoratimimus G13 and the mobility of MGI1313 raise the risk of difficult-to-treat bacterial infections and should be under close surveillance.

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