歴史的なコレクションを時空間的に分析するためのベイズ法.カボベルデの固有植物を用いたケーススタディ

Bayesian Methods to Analyze Historical Collections in Time and Space: A Case Study Using Cabo Verde Endemic Flora.

• Maria M Romeiras
• Mark Carine
• Maria Cristina Duarte
• Silvia Catarino
• Filipe S Dias
• Luís Borda-de-Água

抄録

生物学的コレクション（標本を含む）は、生物多様性データのユニークな情報源であり、特定の地理的地域の知識の発展と蓄積の歴史を知る窓を提供しています。発見のプロセスが知識にどのような影響を与えるかを理解することは、固有種の多様性が高く、絶滅の危機に瀕している分類群の割合が高いことが多い海洋性の島々にとって特に重要である。マカロネシア地域の群島（アゾレス諸島、カナリア諸島、サヴァージュ諸島、マデイラ諸島、カーボベルデ諸島）は、17世紀末以降、科学探検隊の注目の的となってきた。しかし、その植物相の収集、発見、記述の歴史的プロセスを記述した統合的な研究はない。本研究では、カーボベルデの固有種である血管精子植物をケーススタディとして用いて、植物相の採集の歴史を見直し、ベイズ法を適用して、群島の9つの島々にまたがる時間と空間を通して、種の発見の蓄積を評価した。その結果、植物相の知識の発展には、自然の特徴（例：面積、年齢、最高高度、地形の不整地指数の平均値）だけでなく、歴史的要因（例：主要な港の位置）が中心的な役割を果たしていることが明らかになった。群島における種の記述のプロセスを決定してきた主な要因と、それが群島全体の多様性パターンの理解にどのように影響を与えているかについて議論する。

Biological collections, including herbarium specimens, are unique sources of biodiversity data presenting a window on the history of the development and accumulation of knowledge of a specific geographical region. Understanding how the process of discovery impacts that knowledge is particularly important for oceanic islands which are often characterized by both high levels of endemic diversity and high proportions of threatened taxa. The archipelagos of the Macaronesian region (i.e. Azores, Canaries, Savages, Madeira, and Cabo Verde) have been the focus of attention for scientific expeditions since the end of the 17th century. However, there is no integrated study describing the historical process of collecting, discovery and description of its flora. Using as a case study the Cabo Verde endemic angiosperm flora, we review the history of collecting in the flora and apply a Bayesian approach to assess the accumulation of species discovery, through time and space across the nine islands of the archipelago. Our results highlight the central role not only of natural characteristics (e.g. area, age, maximum altitude and average value of the terrain ruggedness index) but also historical factors (i.e. the location of major harbors) for the development of knowledge of the flora. The main factors that have determined the process of species description in the archipelago and how this impact our understanding of diversity patterns across archipelagos are discussed.

Copyright © 2020 Romeiras, Carine, Duarte, Catarino, Dias and Borda-de-Água.