sp. nov.は、中国珠江の河口堆積物から単離された新規細菌であり、 comb. nov.とcom. nov.として属内に移管された

sp. nov., a novel bacterium isolated from the estuarine sediment of the Pearl River in China, and transfer of and to the genus as comb. nov. and comb. nov.

• Shuangfei Zhang
• Haixin Zhou
• Chongran Sun
• Zhong Hu
• Hui Wang

抄録

中国・珠江の河口堆積物からグラム陰性の好気性棒状非滑動性菌を分離し、q18株と命名した。コロニーは48時間培養後の海洋寒天上で円形、平滑、黄色であった。最適な生育のための塩分濃度、温度、pHはそれぞれ5"Zs_200A"%(NaCl)、30℃、7であった。菌株q18の16S rRNA遺伝子配列は、CC-CZW007の型株と97.3"Zs_200A"%の最も高い類似性を示した。16S rRNA遺伝子配列を用いた系統解析により，q18株は属に属し，既知のすべての種とは異なることが明らかになった。q18株から検出された主要な呼吸器キノンはメナキノン（MK-6）であった。主な脂肪酸はiso-Cおよびiso-C 3-OHであった。株ｑ１８の極性脂質は、主にホスファチジルエタノールアミン、未同定アミノ脂質２種、未同定リン脂質２種、未同定極性脂質１種であった。ゲノムのG+C含量は〜42.8mol%であった。株q18のドラフトゲノムサイズは3.3Mbpであった。平均ヌクレオチド同一性値は、株q18と参照株との間で約79.0"Zs_200A"%であった。多相解析の結果，q18株は同属の新種であることが確認され，sp.nov.と命名された。型株はq18（=CICC 24821=KCTC 72764）である。さらに、系統解析、化学軸索学的解析、表現型解析の結果に基づき、これまでに同属に分類されていた2種 , Kim .2018 と Thevarajoo .2016 をそれぞれ comb. nov.と comb. nov.として本属に移行した。

A Gram-negative, aerobic, rod-shaped, non-motile by gliding bacterium was isolated from the estuarine sediment of the Pearl River in PR China and designated as strain q18. Colonies were circular, smooth and yellow on marine agar after 48 h cultivation. Salinity, temperature and pH for optimal growth were 5 % (NaCl), 30 °C and 7, respectively. The 16S rRNA gene sequence of the strain q18 showed the highest similarity of 97.3 % to the type strain of CC-CZW007. 16S rRNA gene-based phylogenetic analysis indicated that strain q18 grouped into the genus in the family of the phylum , and was distinct from all known species in the genus. Menaquinone (MK-6) was the main respiratory quinone detected in strain q18. The major fatty acids were iso-C and iso-C 3-OH. The polar lipids of strain q18 mainly comprised phosphatidylethanolamine, two unidentified aminolipids, two unidentified phospholipids and one unidentified polar lipid. The G+C content of the genome was ~42.8 mol%. The draft genome size of strain q18 was 3.3 Mbp. The average nucleotide identity values were around 79.0 % between strain q18 and reference strains. Based on the polyphasic analysis, strain q18 was confirmed to represent a novel species of the genus , for which the name sp. nov., is proposed. The type strain is q18 (=CICC 24821=KCTC 72764 ). Further, based on the results of phylogenetic, chemotaxonomic and phenotypic analyses, two species previously classified into the genus , Kim . 2018 and Thevarajoo . 2016, are transferred to the genus as comb. nov. and comb. nov. respectively.