パキスタンのニーマンピック病患者における遺伝子の変異スペクトル

/ /

日本語AIでPubMedを検索

PubMedの提供する医学論文データベースを日本語で検索できます。AI(Deep Learning)を活用した機械翻訳エンジンにより、精度高く日本語へ翻訳された論文をご参照いただけます。

Pak J Med Sci.2020 Mar-Apr;36(3):479-484. PJMS-39-479. doi: 10.12669/pjms.36.3.467.

パキスタンのニーマンピック病患者における遺伝子の変異スペクトル

Mutational spectrum of gene in Pakistani Niemann-Pick disease patients.

Huma Arshad Cheema
Iqra Ghulam Rasool
Muhammad Nadeem Anjum
Muhammad Yasir Zahoor

PMID: 32292456 PMCID: PMC7150380. DOI: 10.12669/pjms.36.3.467.

抄録

目的:

パキスタン人のまれな常染色体劣性ニーマンピック病（NPD）患者の遺伝的変異解析

Objective: Genetic variation analysis of rare autosomal recessive Niemann-Pick disease (NPD) Pakistani patients.

方法:

Niemann-Pick病に罹患している7人の無縁の散発性患者を対象に、標的型エクソームシークエンシングにより、その全コーディング領域とフランキング領域を含む遺伝子の塩基配列を決定した。遺伝子バリアントマッピングとそのタンパク質予測を異なるバイオインフォマティクスツールを用いて評価し、臨床表現型を相関させた。研究は、2018年1月から2019年3月までラホール小児病院で行われました。

Methods: We sequenced the gene including its all coding and flanking regions in seven unrelated sporadic patients suffering from Niemann-Pick disease through targeted exome sequencing. Genetic variants mapping and their protein predictions were evaluated using different bioinformatics tools and clinical phenotypes were correlated. The study was conducted from January 2018 to March 2019 at The Children's Hospital Lahore.

結果:

1人の患者の新規ホモ接合性ミスセンス変異（c.1718G>C）（p.Trp573Ser）を持つ登録患者の遺伝子における5つの異なる変異をマッピングしました。ミセンス変異(c.1267C>T) (p.His423Tyr)が3人の無関係の患者で確認された。ナンセンス突然変異(c.1327C>T) (p.Arg443Term)とミスセンス突然変異(c.1493G>A) (p.Arg498His)がそれぞれ1人の患者でマップされました。複合ヘテロ接合変異は、1人の患者にマップされた (c.740G>A) (p.Gly247Asp); (c.1493G>A) (p.Arg498His)。この変異体の病原性はin-silico解析により予測されており、世界の一般的な集団では報告されていない。

Results: We have mapped five different mutations in gene of enrolled patients with a novel homozygous missense variant (c.1718G>C) (p.Trp573Ser) in one patient. A missense mutation (c.1267C>T) (p.His423Tyr) has been identified in three unrelated patients. A nonsense mutation (c.1327C>T) (p.Arg443Term) and one missense mutation (c.1493G>A) (p.Arg498His) mapped in one patient each. A compound heterozygous mutation has been mapped in one patient (c.740G>A) (p.Gly247Asp); (c.1493G>A) (p.Arg498His). Pathogenic effect of novel variant has been predicted through in-silico analysis and has not been reported in general overall population in the globe.

結論:

パキスタンにおけるニーマンピック病の遺伝的人口統計学的評価を行った最初の報告である。マップされた突然変異は、パキスタン人集団の疾患変異アルゴリズムを構築するのに役立つであろう。これは、疾患の臨床的な大きさを決定するとともに、罹患家族への遺伝学的スクリーニングサービスの提供に利用されるであろう。

Conclusion: This is the first report of genetic demographic assessment of Niemann-Pick disease in Pakistan. The mapped mutations would be helpful to build a disease variants algorithm of Pakistani population. This will be used for determining disease clinical magnitude along with provision of genetic screening services in affected families.