sp. nov. 北極圏の表層堆積物から分離された

sp. nov., isolated from Arctic surface sediment.

• Zhao-Zhong Du
• Liu-Yan Zhou
• Tao-Jie Wang
• Hui-Rong Li
• Zong-Jun Du

抄録

グラム染色陰性、好気性、非増殖性、非滑動性、黄色色素と棒状の細菌株、1KV19を指定し、北極圏の湾の近くで採取した表層堆積物のサンプルから分離されました。1KV19は1-4"Zs_200A"% (w/v) NaCl (最適、2"Zs_200A"%)、4-35℃ (最適、25-30℃)、pH6.5-8.0 (最適、pH7.0-7.5)で生育した。16S rRNA遺伝子配列に基づいて系統樹を作成したところ、1KV19株が属に関連しており、325-5株との16S rRNA遺伝子配列類似度が最も高く、98.1"Zs_200A"%の類似度を有していた。1KV19株と他種の型株との類似度は95.9～97.6"Zs_200A"%の範囲であった。また、1KV19株と近縁種との間の平均ヌクレオチド同一性およびデジタルDNA-DNAハイブリダイゼーション値は、それぞれ76.4-79.1および19.9-22.3"Zs_200A"%であった。1KV19株の主要な細胞性脂肪酸はiso-C 3-OH、iso-Cおよびiso-CHであった。呼吸器キノンはMK-6であった。株１ＫＶ１９の主要な極性脂質は、ホスファチジルエタノールアミン、未確認アミノ脂質１種、未確認極性脂質２種であった。株1KV19とその系統親戚との間の表現型、遺伝子型および化学運動学的差異は、株1KV19は、その属の新種を表すものとみなされるべきであることを示している、そのための名前sp.型株は1KV19 (=KCTC 62595=MCCC 1H00307)である。

A Gram-stain-negative, aerobic, non-motile, non-gliding, yellow-pigmented and rod-shaped bacterial strain, designated 1KV19, was isolated from a surface sediment sample collected near a bay in the Arctic. Growth of strain 1KV19 occurred in 1-4 % (w/v) NaCl (optimum, 2 %), at 4-35 °C (optimum, 25-30 °C) and at pH 6.5-8.0 (optimum, pH 7.0-7.5). The phylogenetic trees based on the 16S rRNA gene sequences showed that strain 1KV19 was associated with the genus and had the highest 16S rRNA gene sequence similarity to 325-5 with 98.1 % similarity. Similarity values between strain 1KV19 and the type strains of other species were in the range 95.9-97.6 %. The average nucleotide identity and digital DNA-DNA hybridization values between strain 1KV19 and related species of the genus were 76.4-79.1 and 19.9-22.3 %, respectively. The major cellular fatty acids of strain 1KV19 were iso-C 3-OH, iso-C and iso-C H. The respiratory quinone was MK-6. The major polar lipids of strain 1KV19 were phosphatidylethanolamine, one unidentified aminolipid and two unidentified polar lipids. The phenotypic, genotypic and chemotaxonomic differences between strain 1KV19 and its phylogenetic relatives indicate that strain 1KV19 should be regarded as representing a novel species in the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is 1KV19 (=KCTC 62595=MCCC 1H00307).