半島マレーシア出身の東南アジア系インド人271人におけるHLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1対立遺伝子とハプロタイプ

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Hum. Immunol..2020 Jun;81(6):263-264. S0198-8859(20)30220-2. doi: 10.1016/j.humimm.2020.04.004.Epub 2020-04-18.

半島マレーシア出身の東南アジア系インド人271人におけるHLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1対立遺伝子とハプロタイプ

HLA-A, -B, -C, -DRB1 and -DQB1 alleles and haplotypes in 271 Southeast Asia Indians from Peninsular Malaysia.

Ahmad Fauzi Nurul-Aain
Lay-Kim Tan
Hussein Heselynn
Shahril Nor-Shuhaila
Mageswaran Eashwary
Sulaiman Wahinuddin
Ing Soo Lau
Suk Chyn Gun
Mohamed-Said Mohd-Shahrir
Mohd-Mokhtar Ainon
Rosman Azmillah
Othman Muhaini
Murad Shahnaz
Chun-Lai Too

PMID: 32312605 DOI: 10.1016/j.humimm.2020.04.004.

抄録

半島マレーシア出身の東南アジア系インド人271人を対象に、ポリメラーゼ連鎖反応塩基配列特異的オリゴヌクレオチドプローブハイブリダイゼーション法を用いてHLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1遺伝子座の遺伝子型を決定した。今回の報告では、HLA-BとHLA-DQB1はHardy-Weinbergプロポーション（HWEP）にあった（p>0.05）。HLA-A（p<0.05）、HLA-C（p<0.01）、HLA-DRB1（p<0.01）の各遺伝子座でHWEPからの有意なずれが観察されました。この遺伝子型データは、Alle Frequencies Network Database (AFND) Dos Santos et al. (2016)に掲載されている。

A total of 271 Southeast Asia Indians from Peninsular Malaysia were genotyped for HLA-A, -B, -C, -DRB1, and -DQB1 loci using polymerase chain reaction sequence-specific oligonucleotide probe hybridization methods. In this report, HLA-B and HLA-DQB1 was in Hardy-Weinberg proportions (HWEP) (p > 0.05). We observed significant deviation from the HWEP for HLA-A (p < 0.05), HLA-C (p < 0.01) and HLA-DRB1 (p < 0.01) loci. This genotype data is available in Allele Frequencies Network Database (AFND) Dos Santos et al. (2016).