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古代のゲノムから明らかになった中国のカシミア生産ヤギの進化の歴史と起源
Ancient Genomes Reveal the Evolutionary History and Origin of Cashmere-Producing Goats in China.
PMID: 32324877 PMCID: PMC7306693. DOI: 10.1093/molbev/msaa103.
抄録
ヤギは世界で最も多く飼育されている家畜の一つであるが、東アジアへの移動経路や現地での進化の歴史は未だによくわかっていない。本研究では、新石器時代後期から鉄器時代までの中国古代ヤギゲノム27本を解析した。その結果、古代中国ヤギと現代中国ヤギの間には密接な遺伝的親和性があり、遺伝的連続性があることが明らかになった。その結果、中国ヤギは肥沃三日月周辺の東部地域が原産であることがわかり、中国ヤギの祖先はこの地域からカルコリス時代に分岐したと推定された。現代の中国ヤギは、中国で最も顕著な気候区分に合わせて北部と南部に分かれており、毛包形成に関連する2つの遺伝子、FGF5とEDA2Rは、これらの集団間で高度に分岐していたことがわかった。その結果、中国北部のヤギではFGF5の近くに原因となるde novo欠失の可能性が高い遺伝子が存在し、時間の経過とともに頻度が高くなったのに対し、EDA2Rでは新石器時代にまで遡る定常的な変異が見られた。この結果は、中国ヤギの遺伝的構成と局所的な進化過程の理解を深めるものである。
Goats are one of the most widespread farmed animals across the world; however, their migration route to East Asia and local evolutionary history remain poorly understood. Here, we sequenced 27 ancient Chinese goat genomes dating from the Late Neolithic period to the Iron Age. We found close genetic affinities between ancient and modern Chinese goats, demonstrating their genetic continuity. We found that Chinese goats originated from the eastern regions around the Fertile Crescent, and we estimated that the ancestors of Chinese goats diverged from this population in the Chalcolithic period. Modern Chinese goats were divided into a northern and a southern group, coinciding with the most prominent climatic division in China, and two genes related to hair follicle development, FGF5 and EDA2R, were highly divergent between these populations. We identified a likely causal de novo deletion near FGF5 in northern Chinese goats that increased to high frequency over time, whereas EDA2R harbored standing variation dating to the Neolithic. Our findings add to our understanding of the genetic composition and local evolutionary process of Chinese goats.
© The Author(s) 2020. Published by Oxford University Press on behalf of the Society for Molecular Biology and Evolution.