インドのオーディシャ州、アッサム州、マニプール州の豚集団における日本脳炎ウイルスの分子疫学

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Infect. Genet. Evol..2020 Sep;83:104325. S1567-1348(20)30156-8. doi: 10.1016/j.meegid.2020.104325.Epub 2020-04-20.

インドのオーディシャ州、アッサム州、マニプール州の豚集団における日本脳炎ウイルスの分子疫学

Molecular epidemiology of Japanese encephalitis virus in pig population of Odisha, Assam and Manipur states of India.

Ankita Datey
Leichombam Mohindro Singh
Uttam Rajkhowa
Birendra Kumar Prusty
Tanuja Saswat
Prabhudutta Mamidi
Luit Moni Barkalita
Rupam Dutta
K Chandradev Sharma
Dinabandhu Sahoo
Probodh Borah
Sarangthem Indira Devi
Soma Chattopadhyay

PMID: 32325193 DOI: 10.1016/j.meegid.2020.104325.

抄録

日本脳炎ウイルス（JEV）は，フラビウイルス科フラビウイルス属に属する．豚はJEVのリザーバーおよび増幅中間宿主として機能している。今回の調査は、インドの3つの異なる地域（Odisha, Assam, Manipur）における豚のJEV感染の有病率を把握するために行われた。JEV の検出には 275 扁桃腺組織を対象に RT-PCR のみを行ったが，合計 857 検体の血清を ELISA と RT-PCR で検査した．その結果，JEVの陽性率はManipur（39，血清中25.5％，扁桃腺10％）で最も高かったが，Assam（15，血清中3.8％，扁桃腺0％）とOdisha（7，血清中1.5％，扁桃腺3.7％）では低かった．JEVのジェノタイプIII（GIII）が優性遺伝型であった．さらにE遺伝子を解析したところ，GIIIではS83G，H76P，E78Q，C55S，S64Wの散発的な変異とV46SとV51Iの2つの一貫した変異が認められた．一方，GI株では単一の変異S118Nが観察された．以上のことから，豚のJEウイルス感染率が高いことから，JEウイルスの継続的なサーベイランスの必要性が示唆され，JEウイルスのヒトへの感染拡大を防ぐための効果的な防除戦略の採用につながると考えられる．

Japanese encephalitis virus (JEV) comes under the family Flaviviridae and genus flavivirus. Pigs act as reservoir and amplifying intermediate host for JEV. The current investigation was conducted to understand the prevalence of JEV infection in pigs in three different geographical sites in India (Odisha, Assam and Manipur). Total 857 serum samples were tested by ELISA and RT-PCR, while only RT-PCR was performed in case of 275 tonsils tissues for detection of JEV. It was observed that JEV prevalence was highest in Manipur (positive 39, 25.5% in serum and 10% in tonsil) but lower in Assam (positive 15, 3.8% in serum and 0% in tonsils) and Odisha (positive 7, 1.5% in serum and 3.7% in tonsils). Genotype III (GIII) of JEV was the dominant genotype. Further, analysis of E gene revealed sporadic mutations of S83G, H76P, E78Q, C55S, and S64W along with two consistent mutations V46S and V51I in GIII. Whereas, a single mutation S118N was observed in the GI strain. In conclusion, the high JE virus infection rate of pig in the current locations suggests the need for continuous surveillance of this virus in pigs which will ultimately help to adopt an effective control strategy to prevent the spread of JE infection to human.