HIV感染者における多様な結核菌株に対するRD-1特異的IFN-γ宿主応答の違いは、ESX-1領域における遺伝子型の違いによって説明できるかもしれない

Differential RD-1-specific IFN-γ host responses to diverse Mycobacterium tuberculosis strains in HIV-uninfected persons may be explained by genotypic variation in the ESX-1 region.

• Michele Tomasicchio
• Jason Limberis
• Ruben van der Merwe
• Rachael Jacobson
• Richard Meldau
• Grant Theron
• Mark Nicol
• Rob Warren
• Keertan Dheda

抄録

目的:

T細胞特異的インターフェロン-ガンマ放出アッセイ（IGRA）の反応における個人間のばらつきと、IGRA検査形式間の不一致は、あまり理解されていません。

OBJECTIVES: Between-person variability in T-cell-specific interferon-gamma release assay (IGRA) responses and discordance between IGRA test formats are poorly understood.

方法:

我々は、活動性結核が確認された同一患者（n = 91）から得られた培養分離株のMycobacterium tuberculosis spoligotypeに応じて層別化したIFN-γ反応（QuantiFERON-TB Gold-In-Tube [QFT-GIT]およびTSPOT-TB）を評価した。さらに、全ゲノムシークエンシングを用いて、RD-1をコードするESX-1領域内での菌株間の違いを分析した。

METHODS: We evaluated the IFN-γ responses (QuantiFERON-TB Gold-In-Tube [QFT-GIT] and TSPOT-TB) stratified according to the Mycobacterium tuberculosis spoligotype of the culture isolate obtained from the same patients with confirmed active tuberculosis (n = 91). We further analysed differences within the RD-1-encoding ESX-1 region between the different strain types using whole genome sequencing.

結果:

HIVに感染していない患者では、ファミリー33に感染した患者のTSPOT.TBおよびQFT-GIT IFN-γ応答は、LAM株と比較して5倍（p＜0.01）、2倍（p＜0.05）高かった（さらに、TSPOT.TB応答は5.6倍、QFT-GIT IFN-γ応答は2倍（p＜0.05）であった。TBの反応は、ファミリー33株とX株、北京株とLAM株に感染した患者でそれぞれ5.6倍［p＜0.05］、2.6倍［p＜0.05］高かった）。多変量解析の結果、株の種類（スポリゴタイピングで決定）はIGRA反応の大きさ（IGRA検査の種類によって異なる）と独立して関連しており、これはMycobacteriumtuberculosisのESX-1領域（次世代シークエンシングで決定）のばらつきによって説明される可能性が高いことが明らかになった。

RESULTS: In HIV-uninfected patients, TSPOT.TB and QFT-GIT IFN-γ responses were 5-fold (p < 0.01) and 2-fold higher (p < 0.05) for those infected with family 33 compared to the LAM strain (additionally, TSPOT.TB responses were 5.6-fold [p < 0.05] and 2.6-fold higher [p < 0.05] for the patients infected with the family 33 versus the X strain and Beijing versus the LAM strain, respectively). Multivariate analysis revealed that strain type (determined by spoligotyping) was independently associated with the magnitude of the IGRA response (varied by IGRA test type) and this is likely explained by variability in the ESX-1 region of Mycobacteriumtuberculosis (determined by next-generation sequencing).

結論:

これらのデータは、IGRA反応における個人間の不均一性、結核菌特異的宿主免疫、および異なるIGRA検査フォーマット間の不一致を理解する上で重要な意味を持っている。

CONCLUSIONS: These data have implications for the understanding of between-person heterogeneity in IGRA responses, Mycobateriumtuberculosis-specific host immunity, and the discordance between different IGRA test formats.

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