sp.nov.は土壌から分離された新規放線菌である

sp. nov., a novel actinobacterium isolated from soil.

• Chaolan Liu
• Yidong Guo
• Li Li
• Xiwei Wang
• Jiafu Lin
• Xinrong Wang
• Jianghua Li
• Yiwen Chu

抄録

sp.nov.は、中国南西部の四川省洪園市で採取した土壌から分離した新規放線菌である。生育温度は15-35℃（最適28℃），pHは6.0-8.0（最適pH7.0），0-2"Zs_200A"%（w/v，NaClなしで最適）であった。H14505株から検出された極性脂質は、ジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルイノシトール、糖脂質および4種類の未同定脂質であった。株H14505の優勢なメナキノンはMK-9(H)とMK-9(H)であり、優勢な脂肪酸(>10"Zs_200A"%)はCω9、Cω8、総特徴量5(アンテイソ-C/ Cω6,9)とCであった。16S rRNA遺伝子と全ゲノム配列から系統解析を行ったところ、H14505株はNEAU-JM1（99.0"Zs_200A"%）およびNEAU-CL2（99.0"Zs_200A"%）と高い類似性を示し、系統樹上では属内で単系統のクラッドを形成していた。しかし、株H14505と近縁種との間のヌクレオチドインデントの平均値やDNA-DNAハイブリダイゼーション値からは、別種に属することが示された。さらに、形態学的検査、生理学的検査、生化学的検査の結果から、H14505株は近縁種とのさらなる表現型の区別が可能であった。以上のことから，H14505株は同属の新種であることが示唆され，sp.nov.型株はH14505株（=JCM 32394=CICC 11042）である。

A novel actinobacterium, designated strain H14505, was isolated from a soil sample collected in Hong Yuan, Sichuan, southwest PR China. The temperature, pH and NaCl ranges for growth were determined to be 15-35 °C (optimum, 28 °C), 6.0-8.0 (optimum, pH 7.0) and 0-2 % (w/v; optimum without NaCl), respectively. The polar lipdis detected for strain H14505 were diphosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, phosphatidylinositol, glycolipid and four unidentified lipids. The predominant menaquinones of strain H14505 were MK-9(H) and MK-9(H), and the prevalent fatty acids (>10 %) were C ω9, C ω8, summed feature 5 (anteiso-C/ C ω6,9) and C. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene and whole-genome sequences indicated that strain H14505 showed high similarity to NEAU-JM1 (99.0 %) and NEAU-CL2 (99.0 %), and formed a monophyletic clade within the the genus in the phylogenetic trees. However, the average nucleotide indentity and DNA-DNA hybridization values between strain H14505 and closely related species showed that it belonged to a distinct species. Furthermore, the results of morphological, physiological and biochemical tests allowed further phenotypic differentiation of strain H14505 from its closest relatives. Thus, it is proposed that strain H14505 represents a novel species of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain of is H14505 (=JCM 32394=CICC 11042).