土壌から分離された新規放線菌

sp. nov., a novel actinomycete isolated from soil.

• Hao Jiang
• Liyuan Han
• Jingjing Li
• Mingying Yu
• Junwei Zhao
• Xiaowei Guo
• Wensheng Xiang
• Xiangjing Wang

抄録

宋山の土壌から新規放線菌NEAU-C151株を分離し，多相解析法を用いて特徴付けを行った。16S rRNAの塩基配列を解析した結果，NEAU-C151株は同属に属し，NRRL 2936株と97.5％，AS-0823株と97.4％，ISP 5166株と97.4"Zs_200A"%の類似度を示した。NEAU-C151株の属名は、化学的分類学的データにより確認された。-細胞内の主要な脂肪酸は-C, C, -C, C (ω7c)と-Cであり，全細胞糖はリボースとグルコースを含んでいた。リン脂質プロファイルは、ジホスファチジルグリセロール（ＤＰＧ）、ホスファチジルエタノールアミン（ＰＥ）、未同定リン脂質（ＰＬ）、未同定脂質（Ｌ）およびホスファチジルイノシトールマンノシド（ＰＩＭ）からなり、メナキノンは、ＭＫ-９（Ｈ）、ＭＫ-９（Ｈ）、ＭＫ-１０（Ｈ）およびＭＫ-９（Ｈ）であった。しかし、他の５種類のハウスキーピング遺伝子（ＤＢＡ、Ｂ、Ｂ）、ＤＮＡ-ＤＮＡ関連性、表現型データに基づく多焦点配列解析により、株ＮＥＡＵ-Ｃ１５１は近縁種と区別できることが判明した。その結果，NEAU-C151株は同属の新種であり，sp.nov.と命名された。型株はNEAU-C151（=CGMCC 4.7498=DSM 107808）である。

A novel actinomycete, designated strain NEAU-C151, was isolated from soil collected from Mount Song and characterized using a polyphasic approach. Analysis of the 16S rRNA gene sequence indicated that strain NEAU-C151 belongs to the genus and exhibited 97.5, 97.4 and 97.4 % similarities to NRRL 2936, AS-0823, and ISP 5166, respectively. The assignment of strain NEAU-C151 to the genus was confirmed by chemotaxonomic data: -C, C, -C, C (ω7c) and -C as the major cellular fatty acids; whole-cell sugars contained ribose and glucose; phospholipid profile consisted of diphosphatidylglycerol (DPG), phosphatidylethanolamine (PE), unidentified phospholipid (PL), unidentified lipids (L) and phosphatidylinositol mannoside (PIM); the menaquinones were MK-9(H), MK-9(H), MK-10(H) and MK-9(H). However, multilocus sequence analysis based on five other house-keeping genes (DBA, B and B), DNA-DNA relatedness and phenotypic data showed that strain NEAU-C151 could be distinguished from its closest relatives. Consequently, strain NEAU-C151 represents a novel species of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is NEAU-C151 (=CGMCC 4.7498=DSM 107808).