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Int. J. Syst. Evol. Microbiol..2020 May;70(5):3241-3246. doi: 10.1099/ijsem.0.004162.

sp. nov. 石畳サンゴから分離された新規放線菌.

sp. nov. a novel actinobacterium isolated from the stony coral .

  • Yuan Zhou
  • Shengxiang Pei
  • Fuquan Xie
  • Li Gu
  • Gaiyun Zhang
PMID: 32375933 DOI: 10.1099/ijsem.0.004162.

抄録

グラム染色陽性で好気性の非増殖性放線菌であるE2A株をサンゴから分離し、多相分類学的手法を用いて検討した。16S rRNA遺伝子配列に基づく系統解析の結果、E2A株は属内で異なる系統を形成し、CCTCC AA 2012022(96.4"Zs_200A"%)およびCCTCC AA 2010012(95.3"Zs_200A"%)と近縁であることがわかった。分離物は、15-35℃、pH5-12、および1-16"Zs_200A"% (w/v) NaClの存在下で増殖した。細胞壁のジアミノ酸は-DAPであった。主な脂肪酸は-C、-CおよびCω8cであった。メナキノンはMK-9(H)が優勢であった。検出された極性脂質は、ジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルコリン、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルメチルエタノールアミン、未同定糖脂質1種、未同定リン脂質1種、未同定アミノ脂質1種であった。ゲノムDNAのG+C含量は68.6mol%であった。今回報告された多相分類学的研究の結果から,E2A株は同属の新種であり,sp.型株はE2A=(JCM 31844=MCCC 1A17150)である。

A novel Gram-stain-positive, aerobic, non-motile actinobacterium, designated strain E2A, was isolated from a coral sample and examined using a polyphasic taxonomic approach. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain E2A formed a distinct phyletic lineage in the genus and was closely related to CCTCC AA 2012022 (96.4 %) and CCTCC AA 2010012 (95.3 %). The isolate grew at 15-35 °C, pH 5-12 and in the presence of 1-16 % (w/v) NaCl. The cell-wall diamino acid was -DAP. Major fatty acids identified were -C, -C and Cω8c. The predominant menaquinone was MK-9(H). The polar lipids detected were diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, phosphatidylethanolamine, phosphatidylmethylethanolamine, one unidentified glycolipid, one unidentified phospholipid and one unidentified aminolipid. The genomic DNA G+C content was 68.6 mol%. Based on the data from the polyphasic taxonomic study reported here, strain E2A represents a novel species within the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is E2A=(JCM 31844=MCCC 1A17150).