奎星塔島沖の浅海熱水系から分離されたsp

sp. nov., isolated from shallow-sea hydrothermal systems off Kueishantao Island.

• Qingfeng Zhang
• Jianing Ye
• Limei Yu
• Dan Lin
• Kai Tang

抄録

グラム染色陽性の非フラゲラ菌で、非滑動性、非滑動性のコッコイデス菌株（JLT9）を、台湾、中華民国の亀山涛島沖の浅海熱水系から分離した。JLT9株は好気性、化学的従属栄養性で、35℃、pH6.0、2.5"Zs_200A"% (w/v) NaClの存在下で最適に増殖した。JLT9はDSM 15273と最も高い16S rRNA配列類似性を示した（98.83"Zs_200A"%）。16S rRNA遺伝子の配列から系統樹を作成したところ，JLT9株は属に属し，JC1078，MCCC 1A05965，GP-T3-3，CAU9536にクラスタリングされていることが判明した。JLT9株と近縁株DSM15273株とのデジタルDNA-DNAハイブリダイゼーション値は34.30"Zs_200A"%であった。DNAのG+C含量は72.43"Zs_200A"mol%であった。支配的な脂肪酸はiso-C（41.4"Zs_200A"%）とiso-C（24.7"Zs_200A"%）であった．JLT9株の極性脂質は、ジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルコリン、ホスファチジルグリセロール、3種の未同定糖脂質および1種の未同定リン脂質から構成されていた。イソプレノイドキノンが優勢であったのはMK-8（H）であった。細胞壁にはオルニチンとセリンが含まれており、ジアミノピメル酸は含まれていなかった。系統情報といくつかの特徴的な表現型に基づいて，JLT9株はこの属の新種であり，sp.型はJLT9株（=CGMCC 1.15779=JCM 31502）である。

A Gram-stain-positive, non-flagellated, non-gliding, coccoid bacterial strain, designated JLT9, was isolated from the shallow-sea hydrothermal system off Kueishantao Island, Taiwan, ROC. Strain JLT9 was aerobic, chemoheterotrophic and grew optimally at 35 °C, at pH 6.0 and in the presence of 2.5 % (w/v) NaCl. Strain JLT9 exhibited highest 16S rRNA gene sequence similarity to DSM 15273 (98.83 %). Phylogenetic trees based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain JLT9 belonged to the genus , clustering with JC1078, MCCC 1A05965, GP-T3-3 and CAU9536. The digital DNA-DNA genome hybridization values between strain JLT9 and the closest related strain DSM 15273 was 34.30 %. The DNA G+C content was 72.43 mol%. The dominant fatty acids were identified as iso-C (41.4 %) and iso-C (24.7 %). The polar lipids of strain JLT9 comprised diphosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, phosphatidylglycerol, three unidentified glycolipid and an unidentified phospholipid. The predominant isoprenoid quinone was MK-8 (H). The cell wall contained ornithine and serine, and no diaminopimelic acid. On the basis of phylogenetic data and several distinct phenotypic characteristics, strain JLT9 represents a novel species of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is JLT9 (=CGMCC 1.15779=JCM 31502).