日本語AIでPubMedを検索
洞窟土壌から分離されたsp
sp. nov., isolated from cave soil.
PMID: 32375943 DOI: 10.1099/ijsem.0.004169.
抄録
中国南西部の貴州省新義県のカルスト洞窟から採取した土壌試料から、グラム染色陽性で運動性のある棒状のエンドスポアー形成株SYSU K30002を分離した。SYSU K30002は、28〜40℃（最適、37℃）、pH5.0〜8.0（最適、pH7.0）、0〜4"Zs_200A"% (w/v) NaClの存在下で増殖した（NaCl非存在下では最適）。細胞壁ペプチドグリカンのタイプはA4（Lys-Asp）であった。SYSU K30002の細胞壁糖はリボース、ガラクトース、マンノースであり、MK-7はメナキノンであった。主な脂肪酸はiso-C、C7アルコール、iso-Cであった。極性脂質はジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルエタノールアミン、未同定リン脂質２種であった。ゲノムDNAのG+C含量は36.1mol%であった。SYSU K30002とその近縁種との間の平均ヌクレオチド同一性値は、種の鑑別のためのカットオフレベル(95-96"Zs_200A"%)以下であった。表現型，化学運動学的およびゲノムの比較から，SYSU K30002株は同属の新種であると考えられ，sp.nov.型株はSYSU K30002 (=KCTC 33955=CGMCC 1.13504)である。
A Gram-stain-positive, motile, rod-shaped and endospore-forming strain, SYSU K30002, was isolated from a soil sample collected from a karst cave in Xingyi county, Guizhou province, south-west China. SYSU K30002 grew at 28-40 °C (optimum, 37 °C), at pH 5.0-8.0 (optimum, pH 7.0) and in the presence of 0-4 % (w/v) NaCl (optimum in the absence of NaCl). The cell-wall peptidoglycan type was A4 (Lys-Asp). The cell-wall sugars of SYSU K30002 were ribose, galactose and mannose, and MK-7 was the menaquinone. The major fatty acids were iso-C, C7 alcohol and iso-C. The polar lipids were diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine and two unidentified phospholipids. The G+C content of the genomic DNA was 36.1 mol%. The average nucleotide identity values between SYSU K30002 and its closest relatives were below the cut-off level (95-96 %) for species delineation. Based on phenotypic, chemotaxonomic and genome comparisons, strain SYSU K30002 represents a novel species of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is SYSU K30002 (=KCTC 33955=CGMCC 1.13504).