sp. nov.は、沿岸海水から単離された

sp. nov., isolated from coastal seawater.

• Liang-Hui Li
• Hai-Min Luo
• Jun-Hui Feng
• Yu-Zhen Ming
• Min-Ling Zheng
• Guang-Yuan Deng
• Cha Chen
• Wen-Jun Li
• Min Xiao
• Ping-Hua Qu

抄録

中国広東省の海岸近くの海水から４株（SYSU SYW-1、SYW-2、SYW-3、XLW-1）を分離した。細胞はグラム染色陰性、好気性、非増殖性、非胞子形成性であった。成長は、16〜40℃の温度範囲（最適、32℃）、4〜8のpH範囲（最適、pH7）、および最大10"Zs_200A"% (w/v) NaClの存在下で観察された。主要な極性脂質は、ジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルコリン、ホスファチジルエタノールアミン及び未同定リン脂質であった。呼吸性キノンはユビキノン8（UQ-8）であり、優勢な脂肪酸はC 3-OH、C、C、Cω9であった。16S rRNA遺伝子とゲノム配列を比較した結果，これらの菌株は，16S rRNA遺伝子の配列類似度が98.8％以下，ゲノム平均ヌクレオチド同一性が95％以下であり，本属の新規菌種であることが確認された。16S rRNAの遺伝子配列に基づく系統樹と28個のタンパク質マーカー配列の連結に基づくタンパク質コンカタマーマーの樹から，本菌は '' TX07-7308 '' と '' E95-16 にクラスター化しているが，他の菌種とは異なる系統群を形成していることが示唆された。4株のDNA G+C含量はそれぞれ32.9％，32.7％，32.9％，32.9"Zs_200A"％であった（ゲノム）。表現型および遺伝子型の特徴から，これらの菌株は本属の新種と考えられ，sp.型株はSYSU SYW-1 (=CGMCC 1.17031=NBRC 113781)である。

Four strains (SYSU SYW-1, SYW-2, SYW-3 and XLW-1) were isolated from seawater near the shore in Guangdong Province, China. Cells were Gram-stain-negative, aerobic, non-motile and non-spore-forming. Growth was observed at a temperature range of 16-40 °C (optimum, 32 °C), a pH range of 4-8 (optimum, pH 7) and in the presence of up to 10 % (w/v) NaCl. The major polar lipids were diphosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, phosphatidylethanolamine and an unidentified phospholipid. The respiratory quinone was ubiquinone 8 (UQ-8), and the predominant fatty acids were C 3-OH, C, C and Cω9. Comparison of 16S rRNA gene and genome sequences confirmed that these strains represented a novel member of the genus , with less than 98.8 % 16S rRNA gene sequence similarity and less than 95 % genomic average nucleotide identity to recognized species. The phylogenetic tree based on 16S rRNA gene sequences and the protein-concatamer tree based on a concatenation of 28 protein marker sequences both indicated that the strains clustered with '' TX07-7308 and '' E95-16, but formed a distinct lineage group among the other members of the genus . The DNA G+C contents of the four strains were determined to be 32.9, 32.7, 32.9 and 32.9 %, respectively (genome). On the basis of phenotypic and genotypic features, the strains are considered to represent a novel species of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is SYSU SYW-1 (=CGMCC 1.17031=NBRC 113781).