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sp. nov. 植物の成長を促進する新規細菌で、ファイトレメディエーションへの応用が期待されている
sp. nov. a novel plant growth-promoting bacterium with potential use in phytoremediation.
PMID: 32375987 DOI: 10.1099/ijsem.0.004167.
抄録
菌株RA15は、オディール湿地（スペイン、ウエルバ）に生育するハロフィート植物の根圏から分離されました。RA15はグラムステイン陰性で、胞子形成を伴わない好気性の桿菌で、クリーム色、不透明、粘性、粘性、凸状の不規則なコロニーを形成し、縁にはうねりがありました。最適な生育条件は、pH7.0と28℃で2.5"Zs_200A"% NaCl (w/v)を添加したトリプティック大豆寒天(TSA)プレート上で観察されたが、4-32℃とpH値5.0-9.0で生育することができた。NaCl耐性範囲は0〜15"Zs_200A"%であった。主要な呼吸器キノンはQ8であったが、Q9も存在した。極性脂質はホスファチジルグリセロールとホスファチジルエタノールアミンが最も多く含まれていた。RA15株とその近縁種との系統および表現型の比較検討の結果，RA15株は本属の新たな代表株である可能性が示唆された。型株はRA15 (=CECT 9079=LMG 29860)である。全ゲノムは5.3Mb、G+C含量は40.4"Zs_200A"mol%である。
Strain RA15 was isolated from the rhizosphere of the halophyte plant growing in the Odiel marshes (Huelva, Spain). RA15 cells were Gram stain-negative, non-spore-forming, aerobic rods and formed cream-coloured, opaque, mucoid, viscous, convex, irregular colonies with an undulate margin. Optimal growth conditions were observed on tryptic soy agar (TSA) plates supplemented with 2.5 % NaCl (w/v) at pH 7.0 and 28 °C, although it was able to grow at 4-32 °C and at pH values of 5.0-9.0. The NaCl tolerance range was from 0 to 15 %. The major respiratory quinone was Q8 but Q9 was also present. The most abundant fatty acids were summed feature 3 (Cω7 and/or Cω6), C8 and C. The polar lipids profile comprised phosphatidylglycerol and phosphatidylethanolamine as the most abundant representatives. Phylogenetic analyses confirmed the well-supported affiliation of strain RA15 within the genus , close to the type strains of , and . Results of comparative phylogenetic and phenotypic studies between strain RA15 and its closest related species suggest that RA15 could be a new representative of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is RA15 (=CECT 9079=LMG 29860). The whole genome has 5.3 Mb and the G+C content is 40.4 mol%.