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sp. nov.はコウノトリの糞便から分離された
sp. nov., isolated from the faeces of an Oriental stork.
PMID: 32375988 DOI: 10.1099/ijsem.0.004163.
抄録
グラム染色陽性の非胞子形成性嫌気性細菌であるH21T32株をコウノトリの糞便から分離した。細胞は球体を形成しており，2対，4対またはコングロマリットを形成しており，固体培地上でのコロニーは淡黄色であった．菌株H21T32は、属、科、目、クラスに属していた。10-37℃（最適温度：30℃）、0-7"Zs_200A"% (w/v) NaCl（最適塩分：0.5"Zs_200A"%）、pH7-9（最適pH：8）で生育した。主な細胞性脂肪酸はC9、C9、Cであり、主な極性脂質はジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルグリセロールであった。呼吸器キノンは検出されなかった。ペプチドグリカンの糖成分はラムノース、リボース、グルコースであった。細胞壁のアミノ酸成分は、Ｌ-アラニン、Ｄ-グルコース、Ｌ-リジン、グリシン、アスパラギン酸であった。株のDNA G+C含量は37.1mol%であった。また、CECT 9157との平均ヌクレオチド同一性は77.02%であり、H21T32株は同属の新種であることが確認され、sp.nov.と命名された。型株はH21T32 (=KCTC 33991=JCM 33222)である。
A novel, Gram-stain-positive, non-spore-forming, facultatively anaerobic bacterium, designated strain H21T32, was isolated from the faeces of an Oriental stork, . Cells formed cocci grouped in pairs, tetrads or conglomerates, and colonies on solid medium were pale yellow. Strain H21T32 belonged to the genus , family , order and class . The 16S rRNA gene sequences of the strain showed 97.06-97.34, 96.17-96.31 and 95.93-96.07 % similarity to the type strains of , and , respectively. The strain grew at 10-37 °C (optimum temperature: 30 °C), with 0-7 % (w/v) NaCl (optimum salinity: 0.5 %) and at pH 7-9 (optimum pH: 8). The main cellular fatty acids were C9, C9 and C. The major polar lipids were diphosphatidylglycerol and phosphatidylglycerol. Respiratory quinones were not detected. Sugar components of the peptidoglycan were rhamnose, ribose and glucose. Amino acid components of the cell wall were l-alanine, d-glucose, l-lysine, glycine and aspartic acid. The DNA G+C content of the strain was 37.1 mol%. Average nucleotide identity between strain H21T32 and CECT 9157 was 77.02 %, confirming that strain H21T32 represents a novel species of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is H21T32 (=KCTC 33991=JCM 33222).