LC3共役機構は、カーゴローディングと細胞外小胞の分泌を規定しています

The LC3-conjugation machinery specifies cargo loading and secretion of extracellular vesicles.

• Elizabeth Delorme-Axford
• Daniel J Klionsky

抄録

このような細胞外小胞は、リソソーム経路を介して分解とリサイクルのために細胞質成分を標的とすることで、ストレスの多い環境下でも細胞の健康を維持するために機能します。一方、非分解性分泌オートファジーは、細胞外分泌を媒介する代替オートファジー機構として機能している。Jayanta Debnathの研究室から発表された最近の研究では、非古典的な分泌のためのカーゴの選択におけるメディエーターとして、LC3共役機構の構成要素が同定されました。LC3依存性細胞外小胞ローディングおよび分泌（LDELS）と呼ばれるこのメカニズムは、分泌オートファジーと細胞外小胞の放出の間の追加のリンクを提供します。

Classical macroautophagy/autophagy functions to maintain cell health during stressful conditions by targeting cytosolic components for degradation and recycling through the lysosomal pathway. In contrast, nondegradative secretory autophagy functions as an alternative autophagy mechanism to mediate extracellular secretion. A recent study published in from the laboratory of Jayanta Debnath has identified components of the LC3-conjugation machinery as mediators in the selection of cargo for nonclassical secretion. Termed LC3-dependent extracellular vesicle loading and secretion (LDELS), this mechanism provides an additional link between secretory autophagy and the release of extracellular vesicles.

ABBREVIATIONS:

ATG、オートファジー関連；BioID、近接依存性ビオチン化；CM、条件付き培地；EV、細胞外小胞；HNRNPK、異種核リボ核タンパク質K；ILVs、腔内小胞。LDELS、LC3依存性EV負荷および分泌、LIR、LC3相互作用領域、MAP1LC3/LC3、微小管関連タンパク質1軽鎖3、MS、質量分析、MVBs、多胞体、ncRNA、ノンコーディングRNA。NSMAF/FAN、中性スフィンゴミエリン酵素活性化関連因子；P-body、処理体；PE、ホスファチジルエタノールアミン；RB1CC1/FIP200、RB1誘導性コイルドコイル1；RBP、RNA結合タンパク質；RNA-seq、RNAシークエンス。ＳＡＦＢ、足場付着因子Ｂ；ＳＩＬＡＣ、細胞培養におけるアミノ酸の安定同位体標識；ＳＭＰＤ３／ｎＳＭａｓｅ２、スフィンゴミエリンホスホジエステラーゼ３；ＴＥＭＭ、透過型電子顕微鏡；ＴＭＴ、タンデムマスタギング。

ABBREVIATIONS: ATG, autophagy-related; BioID, proximity-dependent biotinylation; CM, conditioned medium; EV, extracellular vesicle; HNRNPK, heterogeneous nuclear ribonuclear protein K; ILVs, intralumenal vesicles; LDELS, LC3-dependent EV loading and secretion; LIR, LC3-interacting region; MAP1LC3/LC3, microtubule associated protein 1 light chain 3; MS, mass spectrometry; MVBs, multivesicular bodies; ncRNA, non-coding RNA; NSMAF/FAN, neutral sphingomyelinase activation associated factor; P-bodies, processing bodies; PE, phosphatidylethanolamine; RB1CC1/FIP200, RB1 inducible coiled-coil 1; RBP, RNA-binding protein; RNA-seq, RNA sequencing; SAFB, scaffold-attachment factor B; SILAC, stable isotope labeling of amino acids in cell culture; SMPD3/nSMase2, sphingomyelin phosphodiesterase 3; TEM, transmission electron microscopy; TMT, tandem mass tagging.