新規コロナウイルス2019-nCoVの迅速な生物学的解析のための情報スペクトル法の使用：潜在的な受容体、天然リザーバー、トロピズム、治療/ワクチンターゲットの予測

Use of the informational spectrum methodology for rapid biological analysis of the novel coronavirus 2019-nCoV: prediction of potential receptor, natural reservoir, tropism and therapeutic/vaccine target.

• Veljko Veljkovic
• Júlia Vergara-Alert
• Joaquim Segalés
• Slobodan Paessler

抄録

中国武漢市で最近確認された新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）は、ヒトに影響を及ぼす高病原性コロナウイルスの数を拡大している。SARS-CoV-2は潜在的な伝染病またはパンデミックの脅威であり，この感染症に対する迅速な対応が求められている．本報告書では、情報スペクトル法を用いて、新たに出現したウイルスの起源と自然宿主を特定するとともに、治療法やワクチンの標的となる可能性のあるウイルスを特定した。その結果，新たに出現したSARS-CoV-2は，重症急性呼吸器症候群（SARS）CoVや中東呼吸器症候群（MERS）CoVと密接に関連していることが明らかになった．さらに、よく知られているSARS-CoV受容体（ACE2）が、この新規ウイルスの受容体である可能性も示唆された。また，アクチン蛋白質はSARS-CoV-2の細胞侵入や病原性に関与する宿主因子であることが示唆され，この蛋白質の生物学的活性を調節する薬剤（イブプロフェンなど）がこのウイルス感染症の治療薬の候補となる可能性が示唆された．また、SARS-CoV-2の天然リザーバーとしては、シベットや家禽が候補となる可能性があり、SARS-CoV-2のS1タンパク質のドメイン288-330が治療やワクチンの標的となる可能性があることが示唆された。

A novel coronavirus recently identified in Wuhan, China (SARS-CoV-2) has expanded the number of highly pathogenic coronaviruses affecting humans. The SARS-CoV-2 represents a potential epidemic or pandemic threat, which requires a quick response for preparedness against this infection. The present report uses the informational spectrum methodology to identify the possible origin and natural host of the new virus, as well as putative therapeutic and vaccine targets. The performed analysis indicates that the newly emerging SARS-CoV-2 is closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS)-CoV and, to a lesser degree, Middle East respiratory syndrome (MERS)-CoV. Moreover, the well-known SARS-CoV receptor (ACE2) might be a putative receptor for the novel virus as well. Actin protein was also suggested as a host factor that participates in cell entry and pathogenesis of SARS-CoV-2; therefore, drugs modulating biological activity of this protein (e.g. ibuprofen) were suggested as potential candidates for treatment of this viral infection. Additional results indicated that civets and poultry are potential candidates for the natural reservoir of the SARS-CoV-2, and that domain 288-330 of S1 protein from the SARS-CoV-2 represents promising therapeutic and/or vaccine target.

Copyright: © 2020 Veljkovic V et al.