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IUCrJ.2020 May;7(Pt 3):375-382. jt5043. doi: 10.1107/S2052252520003632.Epub 2020-04-10.

Alongshanウイルス由来NS3様ヘリカーゼの結晶構造

Crystal structure of the NS3-like helicase from Alongshan virus.

  • Xiaopan Gao
  • Kaixiang Zhu
  • Justyna Aleksandra Wojdyla
  • Pu Chen
  • Bo Qin
  • Ziheng Li
  • Meitian Wang
  • Sheng Cui
PMID: 32431821 PMCID: PMC7201283. DOI: 10.1107/S2052252520003632.

抄録

Alongshan virus(ALSV)は、中国で確認され、2019年に欧州大陸に急速に広がった新興のヒト病原体で、公衆衛生上の懸念が高まっている。ALSVは、セグメント化されたRNAゲノムを持つファミリー内の明確なグループに属しています。ALSVゲノムのセグメント2と4が起源不明のVP1-VP3タンパク質をコードしているのに対し、セグメント1と3は非構造タンパク質に関連するNS2b-NS3とNS5タンパク質をコードしており、ファミリー内のセグメント化されたウイルスと非セグメント化されたウイルスの間に進化的なつながりがあることを示唆している。ここで、ALSV NS3様ヘリカーゼ(NS3-Hel)の酵素活性を調べ、その結晶構造を2.9Å分解能で決定した。ALSV NS3-Helは、NS3ヘリカーゼで測定されたものと同等のATPアーゼ活性を示しました。ALSV NS3-Helの構造は、NS3ヘリカーゼの構造とよく似ています。また、ALSV NS3-HelとNS3ヘリカーゼのアミノ酸配列の同一性は限られているものの、ATPアーゼ活性部位とRNA結合溝の構造的特徴はALSV NS3-Helに保存されていることがわかりました。これらの知見は、創薬設計のための構造的枠組みを提供するものであり、ALSV NS3 と ALSV NS3 ヘリカーゼの両方に対する幅広い抗ウイルス薬の開発の可能性を示唆しています。

Alongshan virus (ALSV) is an emerging human pathogen that was identified in China and rapidly spread to the European continent in 2019, raising concerns about public health. ALSV belongs to the distinct group within the family with segmented RNA genomes. While segments 2 and 4 of the ALSV genome encode the VP1-VP3 proteins of unknown origin, segments 1 and 3 encode the NS2b-NS3 and NS5 proteins, which are related to nonstructural proteins, suggesting an evolutionary link between segmented and unsegmented viruses within the family. Here, the enzymatic activity of the ALSV NS3-like helicase (NS3-Hel) was characterized and its crystal structure was determined to 2.9 Å resolution. ALSV NS3-Hel exhibits an ATPase activity that is comparable to those measured for NS3 helicases. The structure of ALSV NS3-Hel exhibits an overall fold similar to those of NS3 helicases. Despite the limited amino-acid sequence identity between ALSV NS3-Hel and NS3 helicases, structural features at the ATPase active site and the RNA-binding groove remain conserved in ALSV NS3-Hel. These findings provide a structural framework for drug design and suggest the possibility of developing a broad-spectrum antiviral drug against both and .

© Xiaopan Gao et al. 2020.