日本語AIでPubMedを検索
Rpb1pのC末端ドメインの収縮はRad5pによって媒介される
Contractions of the C-Terminal Domain of Rpb1p Are Mediated by Rad5p.
PMID: 32467128 DOI: 10.1534/g3.120.401409.
抄録
C末端ドメイン（CTD）は、RNAポリメラーゼIIの最大のサブユニットであるRpb1pの必須ドメインであり、7アミノ酸配列YSPTSPSの26回のタンデムリピートから構成されています。必須遺伝子内の必須ドメインであるにもかかわらず、我々は以前に、CTDコーディング領域が遺伝的に不安定であることを実証した。さらに、CTD 配列が切断または変異した酵母では、このコーディング領域の自然な遺伝的拡張または収縮を促進して体力を向上させることが可能であることを明らかにした。我々は、CTDコーディング領域内の遺伝的不安定性をモニターするために、TET-OFFレポーターシステムを用いて、CTDが収縮するメカニズムを調べた。CTDの収縮には複製後修復因子Rad5pが必要であるが、拡張とは異なり、相同組換え因子Rad51pとRad52pは必要ではないことを報告した。また、QGRSマッパーで予測されたG-四重鎖形成配列は、CTDの本体と比較して、CTDの非コード鎖に多く存在することがわかった。また、Rad5pに依存したテンプレート切り替えの際に、フォーク反転を介してマイクロホモロジーの位置がズレることで、CTDが収縮することを示唆している。
The C-terminal domain (CTD) is an essential domain of the largest subunit of RNA polymerase II, Rpb1p, and is composed of 26 tandem repeats of a seven-amino acid sequence, YSPTSPS. Despite being an essential domain within an essential gene, we have previously demonstrated that the CTD coding region is genetically unstable. Furthermore, yeast with a truncated or mutated CTD sequence are capable of promoting spontaneous genetic expansion or contraction of this coding region to improve fitness. We investigated the mechanism by which the CTD contracts using a tet-off reporter system for to monitor genetic instability within the CTD coding region. We report that contractions require the post-replication repair factor Rad5p but, unlike expansions, not the homologous recombination factors Rad51p and Rad52p Sequence analysis of contraction events reveals that deleted regions are flanked by microhomologies. We also find that G-quadruplex forming sequences predicted by the QGRS Mapper are enriched on the noncoding strand of the CTD compared to the body of Formation of G-quadruplexes in the CTD coding region could block the replication fork, necessitating post-replication repair. We propose that contractions of the CTD result when microhomologies misalign during Rad5p-dependent template switching via fork reversal.
Copyright © 2020 Stewart et al.