シュードウリジン合成酵素RsuAは、リボソームタンパク質S17によって安定化された集合体の中間体を捕捉します

Pseudouridine Synthase RsuA Captures an Assembly Intermediate that Is Stabilized by Ribosomal Protein S17.

• Kumudie Jayalath
• Sean Frisbie
• Minhchau To
• Sanjaya Abeysirigunawardena

抄録

リボソームは、すべての生物においてタンパク質を合成する大型のリボ核タンパク質複合体である。リボソームバイオジェネシスは、リボソームRNA（rRNA）の転写、リボソームアセンブリ、rRNAの処理および転写後修飾など、細胞内の様々なイベントの同期を必要とする複雑なプロセスである。リボソームのバイオジェネシスは、ヌクレオチド修飾酵素を含む可能性のある様々なアセンブリ因子によって微調整されている。リボソームの小サブユニットであるシュードウリジン合成酵素A（RsuA）は、16Sヘリックス18のU516をシュードウリジル化する。タンパク質RsuAは、リボソームタンパク質S4と構造的に類似したN末端周辺ドメインを含むマルチドメインタンパク質である。我々の研究は、RsuAが好ましくは、リボソームタンパク質S17がネイティブに類似した複合体上で安定化している集合体中間体を結合し、擬ユリジル化することを示している。さらに、N末端ドメインを切り捨てたRsuAは、S4様ドメインの存在がRsuAの基質認識に重要であることを示した。

The ribosome is a large ribonucleoprotein complex that synthesizes protein in all living organisms. Ribosome biogenesis is a complex process that requires synchronization of various cellular events, including ribosomal RNA (rRNA) transcription, ribosome assembly, and processing and post-transcriptional modification of rRNA. Ribosome biogenesis is fine-tuned with various assembly factors, possibly including nucleotide modification enzymes. Ribosomal small subunit pseudouridine synthase A (RsuA) pseudouridylates U516 of 16S helix 18. Protein RsuA is a multi-domain protein that contains the N-terminal peripheral domain, which is structurally similar to the ribosomal protein S4. Our study shows RsuA preferably binds and pseudouridylates an assembly intermediate that is stabilized by ribosomal protein S17 over the native-like complex. In addition, the N-terminal domain truncated RsuA showed that the presence of the S4-like domain is important for RsuA substrate recognition.