エプスタインバーウイルス（ヘルペスウイルス科、リンパクリプトウイルス、HHV-4）の古代の亜種：仮説と事実

[Ancient variants of the Epstein-Barr virus (Herpesviridae, Lymphocryptovirus, HHV-4): hypotheses and facts.]

• K V Smirnova
• N B Senyuta
• A K Lubenskaya
• T E Dushenkina
• V E Gurtsevich

抄録

はじめに:

分子研究により、ウイルスは生命の進化の初期段階で出現したことが明らかになっています。何百万年もの間、ウイルスはそのRNAまたはDNAの中で古い配列を変化させ、新しい配列を獲得することで進化してきた。ほとんどのウイルスは共通の祖先を持っていると考えられている。そのような祖先である古代株は、おそらくエプスタインバーウイルス（EBV）にも存在していたのではないかと考えられます。

INTRODUCTION: Molecular studies have shown that viruses appeared in the early stages of the evolution of life. For millions of years, viruses have evolved by changing old and acquiring new sequences in their RNA or DNA. It is assumed that most viruses have common ancestors. Such an ancestor, an ancient strain, probably existed for Epstein-Barr virus (EBV) as well.

AIM:

EBVの古代株が現代のロシアの民族集団に存続しているかどうかを調べること。

AIM: To find out whether ancient strains of EBV persist in modern Russian ethnic groups today.

材料と方法:

研究の対象は、分子遺伝学的解析に最も適したEBVオンコジーンであった。アンプリコンを両方向に配列決定し、アミノ酸に翻訳されたヌクレオチド配列（LMP1）をEdwardsら1999年に提案された分類を用いて評価した。LMP1変異体間の遺伝的関係を確立するために、MEGAソフトウェアパッケージを用いて隣接結合法により系統樹を構築した。

MATERIAL AND METHODS: The object of the study was the EBV oncogene, which is most suitable for molecular genetic analysis. was amplified from the oral cavity washings obtained from representatives of two ancient ethnic groups of Russia - Tatars and Slavs. The amplicons were sequenced in both directions; their nucleotide sequences translated into amino acid (LMP1) were evaluated using the classification suggested by Edwards et al. 1999. To establish genetic relationships between LMP1 variants, a phylogenetic tree was constructed by the neighbor-joining method using the MEGA software package.

結果と考察:

スラブ人の口腔内洗浄物からのＬＭＰ１配列の解析により、形質転換の程度が異なるＬＭＰ１変異体の存在が示された。B98.5/A, China1, Med-, NCであった。タタール人の口腔洗浄物から得られたLMP1の配列を解析した結果、B95.8/A、China1、Med-などのオンコプロテイン変異体、および分類外の変異体群（LMP1-OK）を同定することができた。重要な発見は、LMP1-Tatと名付けられたタタール人由来のLMP1の7つの変異体を同定したことで、コドン312-316と382-386に5aaの2つのユニークな欠失を含むLMP1-Tatが同定された。LMP1-Tat変異体の特異性は、タタール人由来のLMP1配列の系統解析と、オンコプロテインのC末端領域における11回のaaリピートと5回のaa挿入の解析の両方によって確認されている。EBV関連疾患を含む新生物による罹患率および死亡率は、異なるEBV株に感染した2つの民族間で有意な差はなかった。

RESULTS AND DISCUSSION: Analysis of LMP1 sequences from washings of the Slavs oral cavity demonstrated the presence of LMP1 variants with varying degrees of transforming potential: B98.5/A, China1, Med-, and NC. The analysis of LMP1 sequences from washings of Tatar oral cavity also made it possible to identify oncoprotein variants such as B95.8/A, China1, Med-, as well as a group of variants out of classifications (LMP1-OK). An important finding was the identification of 7 variants of LMP1 from Tatars, designated as LMP1-Tat, that contained two unique deletions of 5 aa in codons 312-316 and 382-386, which were absent in the LMP1 variants from Slavs and from previously examined cancer patients and healthy individuals, as well as in sequences from open computer databases. The uniqueness of the LMP1-Tat variant is confirmed both by phylogenetic analysis of LMP1 sequences of Tatar origin and by the analysis of 11 aa repeats and 5 aa insertions in the C-terminal region of the oncoprotein. The morbidity and mortality rates from neoplasms, including EBV-associated pathologies, did not differ significantly between two studied ethnic groups infected with different EBV strains.

結論:

得られたデータから、以下のことが示唆された。1) LMP1-Tatはタタール人の間で存続している進化的に古いEBV株である可能性があり、2) LMP1-TatKはいわゆる「ヴォルガ」EBVウイルス株に属し、ヴォルガ地域の住民に共通する株である。この地域の住民から分離されたEBVの研究を進めれば、LMP1-TatKの起源が明らかになるかもしれない。

CONCLUSION: The data obtained allowed us to suggest that: 1) LMP1-Tat could be refered to an evolutionarily ancient EBV strain that persists among Tatars and; 2) LMP1-TatK belongs to the so-called "Volga" EBV virus strain, the common strain among the population of the Volga region. Extended studies of EBV isolates from residents of this region may probably shed the light on the origin of LMP1-Tat.