SOCRATES：COVID-19の緩和戦略を評価するためのソーシャルコンタクトデータ共有イニシアチブを活用したオンラインツール

SOCRATES: an online tool leveraging a social contact data sharing initiative to assess mitigation strategies for COVID-19.

• Lander Willem
• Thang Van Hoang
• Sebastian Funk
• Pietro Coletti
• Philippe Beutels
• Niel Hens

抄録

目的:

COVID-19の緩和戦略を評価するためのソーシャルコンタクトデータ共有イニシアチブと対話型ツールを確立します。

OBJECTIVE: Establishing a social contact data sharing initiative and an interactive tool to assess mitigation strategies for COVID-19.

結果:

公開されているソーシャルコンタクト調査のデータ共有をオンラインリポジトリとフォーマットガイドラインで整理した。このソーシャルコンタクトデータを、加重ソーシャルコンタクト行列、次世代行列、相対罹患率、R[式：本文参照]の観点から分析した。我々は、場所固有の物理的距離尺度（例えば、学校閉鎖や職場など）を組み込み、伝達ダイナミクスに対するそれらの効果を捕捉した。すべての方法は、R Shinyをベースにしたオンラインアプリケーションで実装し、年齢別の感受性と感染性を持つCOVID-19に適用しました。利用可能な社会的接触データを用いたオンラインツールを用いて、物理的な距離を置くことがCOVID-19の感染を減少させるのにかなりの影響を与えることを示した。この効果自体は、疾患特異的な特徴と介入の選択に関する仮定に依存する。

RESULTS: We organized data sharing of published social contact surveys via online repositories and formatting guidelines. We analyzed this social contact data in terms of weighted social contact matrices, next generation matrices, relative incidence and R[Formula: see text]. We incorporated location-specific physical distancing measures (e.g. school closure or at work) and capture their effect on transmission dynamics. All methods have been implemented in an online application based on R Shiny and applied to COVID-19 with age-specific susceptibility and infectiousness. Using our online tool with the available social contact data, we illustrate that physical distancing could have a considerable impact on reducing transmission for COVID-19. The effect itself depends on assumptions made about disease-specific characteristics and the choice of intervention(s).