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Int. J. Syst. Evol. Microbiol..2019 Jul;69(7):2043-2048. doi: 10.1099/ijsem.0.003423.

海綿体から分離されたAltererythrobacter属の新規メンバーであるAltererythrobacter spongiae sp

Altererythrobacter spongiae sp. nov., a novel member of the genus Altererythrobacter isolated from marine sponge.

  • Lingping Zhuang
  • Binbin Lin
  • Dan Chen
  • Guoqiang Li
  • Bo Zhang
  • Lianzhong Luo
PMID: 32553057 DOI: 10.1099/ijsem.0.003423.

抄録

中国海南省楊浦湾から採取した海綿体から分離されたHN-Y73株の分類学的研究を行った。HN-Y73株はグラム染色陰性、非増殖性、卵形から棒状、黄色色素を有し、10-42℃(最適28℃)、pH5.0-9.0(pH8.0)、0.5-16"Zs_200A"% (w/v) NaCl(3-4"Zs_200A"%)中で生育した。この分離株は、酸化酵素、カタラーゼ、アセスキュリンとキシランの加水分解には陽性であったが、カゼインとゼラチンの加水分解には陰性であった。菌株HN-Y73は、最も高い16S rRNA遺伝子配列類似性をAltererythrobacter endophyticus BR75 (96.9"Zs_200A"%)と共有し、Altererythrobacter estronivorus MH-B5 (96.0"Zs_200A"%)、Altererythrobacter indicus MSSRF26 (95.9"Zs_200A"%)、およびAltererythrobacter mangrovi C9-11 (95.7"Zs_200A"%)が続いた。系統樹の結果,HN-Y73株は,A. endophyticus BR75株,A. indicus MSSRF26株,A. estronivorus MH-B5株とともにアルテロリースロバクター属に属していることがわかった。支配的な脂肪酸は、特徴8(C18"Zs_200A":"Zs_200A"1ω7c/ω6c)とC19"Zs_200A":"Zs_200A"0シクロω8cを合計したものであった。主要な極性脂質は、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルグリセロール、ジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルコリン、スフィンゴ糖脂質ホスファチジルジメチルエタノールアミン、ホスファチジルモノメチルエタノールアミン、正体不明の糖脂質1種、正体不明のリン脂質2種、正体不明の脂質4種から構成された。呼吸性リポキノンはQ-10と同定した。ゲノムDNAのG+Ccontentは57.6mol%であった。以上の結果から,HN-Y73株はAltererythrobrobacter属の新種であり,Altererythrobacter spongiae sp.型はHN-Y73(=MCCC 1K03324=LMG 30461)である。

A taxonomic study was carried out on strain HN-Y73, which was isolated from sponge collected from Yangpu Bay, Hainan, PR China. Strain HN-Y73 was Gram-stain-negative, non-motile, ovoid- to rod-shaped, yellow-pigmented and could grow at 10-42 °C (optimum, 28 °C), at pH 5.0-9.0 (pH 8.0) and in 0.5-16 % (w/v) NaCl (3-4 %). This isolate was positive for oxidase, catalase and the hydrolysis of aesculin and xylan, but negative for the hydrolysis of casein and gelatin. Strain HN-Y73 shared the highest 16S rRNA gene sequence similarity with Altererythrobacter endophyticus BR75 (96.9 %), followed by Altererythrobacter estronivorus MH-B5 (96.0 %), Altererythrobacter indicus MSSRF26 (95.9 %) and Altererythrobacter mangrovi C9-11 (95.7 %). The phylogenetic tree showed that strain HN-Y73 forms a clade with A. endophyticus BR75, A. indicus MSSRF26 and A. estronivorus MH-B5 within the genus Altererythrobacter. The dominant fatty acids were summed feature 8 (C18 : 1ω7c/ω6c) and C19 : 0cyclo ω8c. The major polar lipids comprised phosphatidylethanolamine, phosphatidylglycerol, diphosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, sphingoglycolipid phosphatidyldimethylethanolamine, phosphatidylmonomethylethanolamine, one unidentified glycolipid, two unidentified phospholipids and four unidentified lipids. The respiratory lipoquinone was identified as Q-10. The G+C content of the genomic DNA was 57.6 mol%. Based on the phenotypic and phylogenetic data, strain HN-Y73 represents a novel species of the genus Altererythrobacter, for which the name Altererythrobacter spongiae sp. nov. is proposed. The type strain is HN-Y73 (=MCCC 1K03324=LMG 30461).