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セネガルのメディナ・グーナス（ゲディアウェイ）におけるアジア起源のデングウイルス血清型I型の循環をモバイルラボが明らかにした
Mobile Laboratory Reveals the Circulation of Dengue Virus Serotype I of Asian Origin in Medina Gounass (Guediawaye), Senegal.
PMID: 32560073 PMCID: PMC7345902. DOI: 10.3390/diagnostics10060408.
抄録
サハラ以南のアフリカではマラリアの制圧に成功しているため，マラリアによる発熱の発生率は減少しているが，非マラリア熱性疾患（NMFI）の患者の割合は増加している．NMFIの臨床診断は特異的でない症状のために妨げられているが，早期診断はより良い患者ケアと疾病管理のための重要な要素である．本研究の目的は、リコンビナーゼポリメラーゼ増幅（RPA）アッセイに基づく移動検査室を用いて、低資源環境下でのNMFIのアルボウイルスの病因を決定することであった。この研究では、デングウイルス（DENV）、ジカウイルス（ZIKV）、黄熱病ウイルス（YFV）、チクングニアウイルス（CHIKV）、リフトバレー熱病ウイルス（RVFV）の5つのアルボウイルスに検査パネルを拡大した。生後 1 か月から 115 か月までの小児 104 名が登録され、スクリーニングを受けた。外来診療所に受診した 10 歳未満の小児 104 例の血液サンプルのうち 3 例が DENV の陽性反応を示した．その結果はRT-PCR、部分シーケンシング、ELISA（Biorad, France）による非構造タンパク質1（NS1）抗原捕捉で確認された。由来のDENV-1配列の系統解析は、2014年に中国の広州から分離されたDENV-1の配列とクラスター化した。結論として、このモバイルセットアップはNMFIの原因菌の迅速な同定に信頼性があることが証明され、リファレンスラボの設定で得られた結果と一致していた。
With the growing success of controlling malaria in Sub-Saharan Africa, the incidence of fever due to malaria is in decline, whereas the proportion of patients with non-malaria febrile illness (NMFI) is increasing. Clinical diagnosis of NMFI is hampered by unspecific symptoms, but early diagnosis is a key factor for both better patient care and disease control. The aim of this study was to determine the arboviral aetiologies of NMFI in low resource settings, using a mobile laboratory based on recombinase polymerase amplification (RPA) assays. The panel of tests for this study was expanded to five arboviruses: dengue virus (DENV), zika virus (ZIKV), yellow fever virus (YFV), chikungunya virus (CHIKV), and rift valley fever virus (RVFV). One hundred and four children aged between one month and 115 months were enrolled and screened. Three of the 104 blood samples of children <10 years presented at an outpatient clinic tested positive for DENV. The results were confirmed by RT-PCR, partial sequencing, and non-structural protein 1 (NS1) antigen capture by ELISA (Biorad, France). Phylogenetic analysis of the derived DENV-1 sequences clustered them with sequences of DENV-1 isolated from Guangzhou, China, in 2014. In conclusion, this mobile setup proved reliable for the rapid identification of the causative agent of NMFI, with results consistent with those obtained in the reference laboratory's settings.