日本語AIでPubMedを検索
バングラデシュのバリシャール地域の在来牛のジェノタイピングと遺伝子の解析
Genotyping of and genes in native cattle from Barishal region of Bangladesh.
PMID: 32567473 DOI: 10.1080/10495398.2020.1781145.
抄録
本研究は、在来牛の遺伝的変異と遺伝子を決定するために実施された。DNA は、Babuganj, Barishal から採取した血液サンプル（=80）から抽出し、遺伝子特異的プライマーを用いて PCR を行った。ジェノタイピングはRFLPと制限酵素を用いて行った。対立遺伝子頻度、遺伝子型頻度、遺伝的多様性、ヘテロ接合性、ハーディー・ワインバーグ平衡をPopgen32ソフトウェアを用いて推定した。合計80サンプルをジェノタイピングし、AA、AB、BBの3つの遺伝子型を検出した。遺伝子の場合、AA遺伝子型（0.73）の方が頻度が高く、次いでAB遺伝子型（0.23）、BB遺伝子型（0.04）の順であった。また、A遺伝子型（0.84）がB遺伝子型（0.16）よりも優勢であることがわかった。遺伝子については、BB遺伝子型（0.66）がAB遺伝子型（0.18）、AA遺伝子型（0.16）よりも頻度が高かった。最も頻度が高かったのはB型（0.75）で、次いでA型（0.25）であった。平均遺伝的多様性（He）は0.38であった。この結果は、観測されたヘテロ接合度(Ho)と期待されたヘテロ接合度(He)との間に差があることを示しており、集団内に選択圧力があると仮定した場合、平衡遺伝学的にはアウトオブバランスであることを示している。我々の知る限りでは、本研究はバングラデシュの牛の遺伝子変異解析に関する最初の報告である。
The study was conducted to determine the genetic variants of and genes in native cattle. DNA was extracted from blood samples ( = 80) collected from Babuganj, Barishal followed by PCR with gene-specific primers. Genotyping was done by RFLP with and restriction enzymes. Allelic and genotypic frequencies, genetic diversity, heterozygosity and Hardy-Weinberg equilibrium were estimated using the Popgen32 software. A total 80 samples were genotyped and three genotypes, namely AA, AB and BB, were detected for both the genes. In case of gene, higher frequency was observed for AA genotype (0.73) followed by AB (0.23) and BB (0.04) genotype. A allele (0.84) was found to dominate over B allele (0.16). For gene, BB genotype (0.66) was found more frequently than AB (0.18) and AA (0.16) genotypes. Highest frequency was found for B (0.75) followed by A (0.25) allele. The average genetic diversity (He) was 0.38. The result indicated differences between observed (Ho) and expected (He) heterozygosity and it was out of equilibrium genetics, assumed that selection pressure was in population. To the best of our knowledge, this is the first reported study on and gene variants analysis in cattle in Bangladesh.