C>U RNA編集とヒト疾患バリアントとの関連

Association of C>U RNA Editing with Human Disease Variants.

• Sapan Mandloi
• Zackary Falls
• Rong Deng
• Ram Samudrala
• Peter L Elkin

抄録

RNA編集は、2つの触媒酵素"ADAR"(A>I)と"APOBEC"(C>U)によって行われる重要な転写後のRNA配列修飾である。APOBECが介在するC>U編集は多くのヒト癌と関連しているが、ヒト疾患におけるC>U編集の程度は不明である。ここで、我々は関連研究を行い、配列モチーフ解析（RNASeeプロトコル）によりAPOBEC3A/GのC>U編集を受けると予測される部位に少なくとも1293のヒト疾患バリアントが存在することを明らかにした。これらのバリアントは、がん、代謝障害、網膜症、心筋症、神経変性疾患、免疫不全などの幅広いヒト疾患状態と関連していた。これらの結果は、APOBECを媒介としたC>U RNA編集がヒトの疾患状態に広く、これまで報告されていなかった貢献をしている可能性を示しています。

RNA-editing is an important post-transcriptional RNA sequence modification performed by two catalytic enzymes, "ADAR"(A>I) and "APOBEC"(C>U). Although APOBEC-mediated C>U editing has been associated with a number of human cancers, the extent of C>U editing in human disease remains unclear. Here, we performed an association study and found that at least 1293 human disease variants occur at sites predicted by sequence motif analysis (RNASee protocol) to undergo APOBEC3A/G C>U editing. These variants were associated with a wide array of human disease conditions ranging from cancer, metabolic disorders, retinopathies, cardiomyopathies, neurodegenerative disorders and immunodeficiencies. These results indicate that APOBEC mediated C>U RNA editing may have widespread and previously unreported contributions to human disease conditions.